Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CNGB1Q14028 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CNGB1Q14028 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CNGB1Q14028 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CNGB1Q14028 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CNGB1Q14028 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CNGB1Q14028 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CNGB1Q14028 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CNGB1Q14028 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CNGB1Q14028 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CNGB1Q14028 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CNGB1Q14028 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CNGB1Q14028 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CNGB1Q14028 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CNGB1Q14028 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CNGB1Q14028 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CNGB1Q14028 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CNGB1Q14028 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CNGB1Q14028 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CNGB1Q14028 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CNGB1Q14028 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CNGB1Q14028 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CNGB1Q14028 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CNGB1Q14028 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CNGB1Q14028 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CNGB1Q14028 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CNGB1Q14028 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
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