Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2H3Q13889 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H3Q13889 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H3Q13889 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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