Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA4Q13156 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA4Q13156 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA4Q13156 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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