Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN3Q13033 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRN3Q13033 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STRN3Q13033 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STRN3Q13033 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRN3Q13033 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRN3Q13033 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRN3Q13033 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRN3Q13033 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRN3Q13033 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRN3Q13033 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRN3Q13033 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRN3Q13033 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
STRN3Q13033 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRN3Q13033 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRN3Q13033 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.55■■■□□ 2
STRN3Q13033 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRN3Q13033 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRN3Q13033 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
STRN3Q13033 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STRN3Q13033 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STRN3Q13033 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
STRN3Q13033 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STRN3Q13033 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRN3Q13033 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRN3Q13033 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STRN3Q13033 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
STRN3Q13033 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
STRN3Q13033 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
STRN3Q13033 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
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