Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB3Q05901 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNB3Q05901 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms