Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RELAQ04206 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RELAQ04206 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RELAQ04206 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RELAQ04206 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RELAQ04206 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RELAQ04206 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RELAQ04206 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RELAQ04206 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RELAQ04206 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RELAQ04206 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RELAQ04206 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RELAQ04206 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RELAQ04206 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RELAQ04206 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RELAQ04206 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RELAQ04206 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RELAQ04206 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RELAQ04206 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RELAQ04206 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RELAQ04206 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RELAQ04206 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RELAQ04206 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RELAQ04206 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RELAQ04206 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RELAQ04206 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RELAQ04206 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RELAQ04206 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RELAQ04206 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RELAQ04206 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RELAQ04206 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RELAQ04206 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RELAQ04206 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RELAQ04206 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RELAQ04206 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RELAQ04206 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RELAQ04206 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RELAQ04206 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RELAQ04206 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RELAQ04206 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RELAQ04206 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RELAQ04206 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RELAQ04206 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RELAQ04206 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RELAQ04206 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RELAQ04206 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RELAQ04206 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RELAQ04206 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RELAQ04206 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RELAQ04206 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RELAQ04206 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RELAQ04206 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RELAQ04206 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RELAQ04206 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RELAQ04206 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RELAQ04206 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RELAQ04206 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RELAQ04206 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RELAQ04206 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RELAQ04206 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RELAQ04206 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RELAQ04206 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RELAQ04206 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RELAQ04206 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RELAQ04206 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RELAQ04206 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RELAQ04206 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RELAQ04206 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RELAQ04206 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RELAQ04206 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RELAQ04206 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RELAQ04206 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RELAQ04206 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RELAQ04206 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RELAQ04206 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RELAQ04206 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RELAQ04206 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RELAQ04206 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RELAQ04206 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RELAQ04206 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RELAQ04206 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RELAQ04206 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RELAQ04206 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RELAQ04206 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RELAQ04206 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RELAQ04206 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RELAQ04206 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RELAQ04206 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RELAQ04206 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RELAQ04206 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RELAQ04206 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RELAQ04206 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RELAQ04206 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RELAQ04206 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RELAQ04206 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RELAQ04206 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RELAQ04206 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RELAQ04206 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RELAQ04206 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RELAQ04206 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms