Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUCB2P80303 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NUCB2P80303 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUCB2P80303 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms