Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL6P80162 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL6P80162 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL6P80162 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL6P80162 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL6P80162 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL6P80162 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL6P80162 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL6P80162 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL6P80162 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL6P80162 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL6P80162 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL6P80162 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL6P80162 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL6P80162 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL6P80162 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL6P80162 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL6P80162 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL6P80162 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL6P80162 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL6P80162 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL6P80162 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL6P80162 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CXCL6P80162 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL6P80162 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL6P80162 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL6P80162 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL6P80162 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL6P80162 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL6P80162 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL6P80162 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms