Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP6P55212 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP6P55212 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP6P55212 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP6P55212 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP6P55212 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP6P55212 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP6P55212 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP6P55212 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP6P55212 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP6P55212 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP6P55212 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP6P55212 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP6P55212 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP6P55212 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP6P55212 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP6P55212 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP6P55212 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP6P55212 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP6P55212 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP6P55212 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP6P55212 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP6P55212 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP6P55212 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP6P55212 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP6P55212 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP6P55212 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP6P55212 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP6P55212 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP6P55212 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP6P55212 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP6P55212 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP6P55212 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP6P55212 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP6P55212 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP6P55212 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP6P55212 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP6P55212 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP6P55212 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP6P55212 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP6P55212 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP6P55212 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP6P55212 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP6P55212 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP6P55212 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP6P55212 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP6P55212 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP6P55212 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP6P55212 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP6P55212 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP6P55212 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP6P55212 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP6P55212 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP6P55212 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP6P55212 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP6P55212 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP6P55212 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP6P55212 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP6P55212 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP6P55212 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP6P55212 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP6P55212 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP6P55212 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP6P55212 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP6P55212 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP6P55212 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP6P55212 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP6P55212 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP6P55212 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP6P55212 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP6P55212 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP6P55212 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP6P55212 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP6P55212 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP6P55212 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP6P55212 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP6P55212 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP6P55212 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASP6P55212 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP6P55212 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP6P55212 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP6P55212 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP6P55212 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP6P55212 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP6P55212 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP6P55212 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP6P55212 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP6P55212 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP6P55212 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP6P55212 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP6P55212 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP6P55212 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP6P55212 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP6P55212 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP6P55212 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP6P55212 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP6P55212 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP6P55212 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP6P55212 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP6P55212 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194 ms