Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP1B3P54709 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1B3P54709 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms