Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2KP53803 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2KP53803 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms