Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIMK2P53671 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIMK2P53671 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIMK2P53671 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms