Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ATXN2-204ENST00000392645 2842 ntTSL 215.41■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-228ENST00000599236 586 ntTSL 515.4■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NEPRO-214ENST00000473284 2056 ntTSL 215.36■□□□□ 0.059e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ANP32A-209ENST00000495764 504 ntTSL 515.34■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-214ENST00000596507 1014 ntTSL 515.3■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-222ENST00000597718 884 ntTSL 515.3■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-226ENST00000598932 575 ntTSL 515.3■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-205ENST00000594068 841 ntTSL 515.28■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-206ENST00000518254 755 ntTSL 515.24■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-211ENST00000520329 836 ntTSL 515.24■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FANCD2-206ENST00000435522 567 ntTSL 415.21■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARHGAP4-209ENST00000422918 642 ntTSL 515.16■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OSBPL5-216ENST00000533721 774 ntTSL 415.14■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 03e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 03e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-207ENST00000595023 1131 ntTSL 515.03■□□□□ -03e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-227ENST00000598960 534 ntTSL 415.03■□□□□ -03e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PHF21A-211ENST00000529734 557 ntTSL 414.86□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NEPRO-205ENST00000462295 1382 ntTSL 214.82□□□□□ -0.049e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 RPS6KB1-205ENST00000472940 2808 ntTSL 214.79□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-224ENST00000598086 554 ntTSL 414.7□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ELOC-203ENST00000519082 634 ntTSL 214.66□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NIPA1-203ENST00000557930 582 ntTSL 214.61□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MAP3K4-215ENST00000544041 5444 ntTSL 1 (best)14.57□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-223ENST00000524169 784 ntTSL 314.52□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MAP3K4-207ENST00000490904 5451 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PFDN1-206ENST00000514611 1139 ntTSL 214.48□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-217ENST00000453281 534 ntTSL 214.47□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-213ENST00000444183 526 ntTSL 514.47□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-218ENST00000453776 561 ntTSL 314.34□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-213ENST00000596462 565 ntTSL 514.31□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)14.28□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HDAC8-210ENST00000412342 679 ntTSL 1 (best)14.28□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HDAC8-205ENST00000373568 1037 ntTSL 514.28□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ELL-202ENST00000594635 4074 ntTSL 1 (best)14.22□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-223ENST00000598067 543 ntTSL 514.19□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-220ENST00000597474 556 ntTSL 414.15□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-217ENST00000596865 579 ntTSL 514.14□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-203ENST00000593833 580 ntTSL 414.11□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)14.02□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PSMD5-AS1-214ENST00000640391 707 ntTSL 213.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-208ENST00000434015 580 ntTSL 313.85□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-225ENST00000598539 551 ntTSL 513.85□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-202ENST00000593385 573 ntTSL 513.85□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 UQCRH-203ENST00000486951 687 ntTSL 313.77□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 C1orf198-203ENST00000470540 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PAPLN-207ENST00000555123 4108 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-207ENST00000429501 677 ntTSL 513.57□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-220ENST00000466012 572 ntTSL 513.53□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-234ENST00000600676 3094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MANBA-201ENST00000226578 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MAP3K4-212ENST00000542851 625 ntTSL 213.4□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RNF207-209ENST00000496676 3020 ntTSL 213.37□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OSBPL5-213ENST00000530372 575 ntTSL 413.37□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SPTB-206ENST00000553938 3456 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRDM2-204ENST00000376048 2688 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 61.8
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