Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNNI2P48788 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNI2P48788 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNNI2P48788 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNI2P48788 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TNNI2P48788 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNNI2P48788 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms