Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDKN1BP46527 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN1BP46527 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms