Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGM1P36871 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGM1P36871 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGM1P36871 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGM1P36871 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGM1P36871 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGM1P36871 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PGM1P36871 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGM1P36871 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGM1P36871 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGM1P36871 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGM1P36871 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGM1P36871 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGM1P36871 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGM1P36871 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGM1P36871 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGM1P36871 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGM1P36871 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGM1P36871 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGM1P36871 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGM1P36871 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGM1P36871 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGM1P36871 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGM1P36871 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGM1P36871 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGM1P36871 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGM1P36871 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGM1P36871 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGM1P36871 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGM1P36871 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGM1P36871 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGM1P36871 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGM1P36871 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGM1P36871 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGM1P36871 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGM1P36871 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGM1P36871 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGM1P36871 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGM1P36871 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGM1P36871 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGM1P36871 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGM1P36871 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGM1P36871 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGM1P36871 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGM1P36871 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGM1P36871 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGM1P36871 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGM1P36871 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PGM1P36871 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PGM1P36871 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGM1P36871 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGM1P36871 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGM1P36871 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGM1P36871 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGM1P36871 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGM1P36871 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGM1P36871 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGM1P36871 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGM1P36871 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGM1P36871 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGM1P36871 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGM1P36871 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PGM1P36871 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGM1P36871 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGM1P36871 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGM1P36871 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGM1P36871 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGM1P36871 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGM1P36871 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGM1P36871 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGM1P36871 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGM1P36871 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGM1P36871 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGM1P36871 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGM1P36871 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGM1P36871 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGM1P36871 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGM1P36871 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGM1P36871 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGM1P36871 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGM1P36871 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGM1P36871 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGM1P36871 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGM1P36871 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PGM1P36871 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGM1P36871 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGM1P36871 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PGM1P36871 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGM1P36871 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM1P36871 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM1P36871 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM1P36871 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM1P36871 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM1P36871 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM1P36871 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM1P36871 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM1P36871 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PGM1P36871 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGM1P36871 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGM1P36871 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms