Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RCVRNP35243 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCVRNP35243 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RCVRNP35243 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RCVRNP35243 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RCVRNP35243 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCVRNP35243 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCVRNP35243 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCVRNP35243 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCVRNP35243 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCVRNP35243 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCVRNP35243 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCVRNP35243 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RCVRNP35243 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCVRNP35243 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms