Protein–RNA interactions for Protein: P27986

PIK3R1, Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R1P27986 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PIK3R1P27986 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIK3R1P27986 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R1P27986 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3R1P27986 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms