Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCND1P24385 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCND1P24385 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCND1P24385 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCND1P24385 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCND1P24385 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCND1P24385 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCND1P24385 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCND1P24385 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCND1P24385 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCND1P24385 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCND1P24385 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCND1P24385 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCND1P24385 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCND1P24385 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCND1P24385 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCND1P24385 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCND1P24385 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCND1P24385 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCND1P24385 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCND1P24385 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCND1P24385 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCND1P24385 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCND1P24385 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCND1P24385 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCND1P24385 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCND1P24385 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCND1P24385 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCND1P24385 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCND1P24385 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCND1P24385 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCND1P24385 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND1P24385 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND1P24385 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND1P24385 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND1P24385 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND1P24385 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCND1P24385 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND1P24385 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND1P24385 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND1P24385 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND1P24385 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND1P24385 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCND1P24385 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCND1P24385 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCND1P24385 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCND1P24385 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCND1P24385 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCND1P24385 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCND1P24385 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCND1P24385 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCND1P24385 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCND1P24385 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCND1P24385 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCND1P24385 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCND1P24385 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCND1P24385 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCND1P24385 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND1P24385 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND1P24385 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND1P24385 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND1P24385 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND1P24385 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND1P24385 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND1P24385 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND1P24385 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND1P24385 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND1P24385 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND1P24385 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND1P24385 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND1P24385 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCND1P24385 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCND1P24385 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCND1P24385 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCND1P24385 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCND1P24385 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCND1P24385 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCND1P24385 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND1P24385 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND1P24385 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND1P24385 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND1P24385 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND1P24385 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND1P24385 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND1P24385 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND1P24385 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND1P24385 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND1P24385 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND1P24385 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCND1P24385 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCND1P24385 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCND1P24385 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND1P24385 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND1P24385 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND1P24385 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND1P24385 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND1P24385 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND1P24385 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND1P24385 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND1P24385 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms