Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD58P19256 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD58P19256 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD58P19256 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD58P19256 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD58P19256 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD58P19256 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD58P19256 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD58P19256 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD58P19256 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD58P19256 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD58P19256 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD58P19256 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CD58P19256 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD58P19256 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD58P19256 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD58P19256 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD58P19256 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD58P19256 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD58P19256 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD58P19256 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CD58P19256 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CD58P19256 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CD58P19256 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CD58P19256 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CD58P19256 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD58P19256 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD58P19256 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD58P19256 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD58P19256 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD58P19256 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD58P19256 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD58P19256 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD58P19256 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CD58P19256 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CD58P19256 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CD58P19256 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CD58P19256 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD58P19256 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD58P19256 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD58P19256 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CD58P19256 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD58P19256 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD58P19256 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CD58P19256 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CD58P19256 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CD58P19256 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD58P19256 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD58P19256 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CD58P19256 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD58P19256 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD58P19256 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD58P19256 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD58P19256 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD58P19256 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CD58P19256 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD58P19256 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD58P19256 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CD58P19256 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CD58P19256 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CD58P19256 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CD58P19256 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CD58P19256 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CD58P19256 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD58P19256 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD58P19256 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD58P19256 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD58P19256 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CD58P19256 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD58P19256 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD58P19256 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD58P19256 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD58P19256 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD58P19256 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD58P19256 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD58P19256 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD58P19256 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD58P19256 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD58P19256 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD58P19256 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD58P19256 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD58P19256 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD58P19256 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD58P19256 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD58P19256 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD58P19256 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD58P19256 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD58P19256 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CD58P19256 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD58P19256 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CD58P19256 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD58P19256 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD58P19256 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD58P19256 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD58P19256 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD58P19256 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD58P19256 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CD58P19256 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD58P19256 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD58P19256 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms