Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA2P17301 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA2P17301 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA2P17301 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA2P17301 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA2P17301 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA2P17301 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA2P17301 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA2P17301 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA2P17301 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA2P17301 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA2P17301 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA2P17301 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA2P17301 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA2P17301 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA2P17301 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA2P17301 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms