Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP10827 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP10827 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP10827 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP10827 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP10827 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP10827 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP10827 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP10827 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP10827 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP10827 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP10827 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP10827 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP10827 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP10827 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP10827 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP10827 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP10827 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP10827 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP10827 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP10827 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP10827 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP10827 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25■■□□□ 1.59
THRAP10827 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP10827 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP10827 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP10827 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP10827 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP10827 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP10827 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP10827 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRAP10827 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP10827 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP10827 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP10827 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP10827 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRAP10827 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP10827 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP10827 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP10827 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP10827 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP10827 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRAP10827 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
THRAP10827 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP10827 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP10827 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRAP10827 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
THRAP10827 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP10827 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP10827 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP10827 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRAP10827 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP10827 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP10827 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP10827 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRAP10827 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP10827 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP10827 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP10827 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP10827 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP10827 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP10827 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP10827 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP10827 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP10827 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP10827 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THRAP10827 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP10827 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP10827 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP10827 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRAP10827 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP10827 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP10827 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THRAP10827 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
THRAP10827 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
THRAP10827 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
THRAP10827 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THRAP10827 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THRAP10827 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THRAP10827 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THRAP10827 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THRAP10827 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THRAP10827 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THRAP10827 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THRAP10827 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THRAP10827 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THRAP10827 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THRAP10827 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THRAP10827 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THRAP10827 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THRAP10827 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THRAP10827 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THRAP10827 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THRAP10827 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THRAP10827 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THRAP10827 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THRAP10827 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THRAP10827 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THRAP10827 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THRAP10827 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms