Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM17P0DL12 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM17P0DL12 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms