Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M7

ACSM4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM4P0C7M7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSM4P0C7M7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM4P0C7M7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM4P0C7M7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM4P0C7M7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms