Protein–RNA interactions for Protein: P03891

MT-ND2, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND2P03891 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND2P03891 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MT-ND2P03891 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MT-ND2P03891 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199 ms