Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SSNA1O43805 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSNA1O43805 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSNA1O43805 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSNA1O43805 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSNA1O43805 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSNA1O43805 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSNA1O43805 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSNA1O43805 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSNA1O43805 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSNA1O43805 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSNA1O43805 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSNA1O43805 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSNA1O43805 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSNA1O43805 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSNA1O43805 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSNA1O43805 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSNA1O43805 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSNA1O43805 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSNA1O43805 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSNA1O43805 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SSNA1O43805 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSNA1O43805 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSNA1O43805 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSNA1O43805 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSNA1O43805 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSNA1O43805 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSNA1O43805 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSNA1O43805 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSNA1O43805 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSNA1O43805 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSNA1O43805 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSNA1O43805 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms