Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD51CO43502 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD51CO43502 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD51CO43502 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms