Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SART1O43290 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SART1O43290 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SART1O43290 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SART1O43290 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SART1O43290 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SART1O43290 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SART1O43290 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SART1O43290 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SART1O43290 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SART1O43290 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SART1O43290 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SART1O43290 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SART1O43290 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SART1O43290 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SART1O43290 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SART1O43290 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SART1O43290 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SART1O43290 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SART1O43290 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SART1O43290 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SART1O43290 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SART1O43290 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SART1O43290 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SART1O43290 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SART1O43290 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SART1O43290 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SART1O43290 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SART1O43290 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SART1O43290 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SART1O43290 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SART1O43290 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SART1O43290 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SART1O43290 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SART1O43290 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SART1O43290 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SART1O43290 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SART1O43290 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SART1O43290 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SART1O43290 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SART1O43290 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SART1O43290 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SART1O43290 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SART1O43290 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SART1O43290 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SART1O43290 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SART1O43290 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SART1O43290 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SART1O43290 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SART1O43290 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SART1O43290 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SART1O43290 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SART1O43290 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SART1O43290 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SART1O43290 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SART1O43290 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SART1O43290 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SART1O43290 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SART1O43290 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SART1O43290 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SART1O43290 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SART1O43290 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SART1O43290 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SART1O43290 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SART1O43290 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SART1O43290 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SART1O43290 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SART1O43290 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SART1O43290 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SART1O43290 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SART1O43290 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SART1O43290 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SART1O43290 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SART1O43290 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SART1O43290 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SART1O43290 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SART1O43290 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SART1O43290 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SART1O43290 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SART1O43290 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SART1O43290 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SART1O43290 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SART1O43290 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SART1O43290 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SART1O43290 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SART1O43290 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SART1O43290 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SART1O43290 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SART1O43290 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SART1O43290 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SART1O43290 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SART1O43290 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SART1O43290 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SART1O43290 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SART1O43290 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SART1O43290 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SART1O43290 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SART1O43290 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SART1O43290 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SART1O43290 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms