Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FABP7O15540 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FABP7O15540 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FABP7O15540 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FABP7O15540 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FABP7O15540 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FABP7O15540 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FABP7O15540 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FABP7O15540 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FABP7O15540 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FABP7O15540 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FABP7O15540 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FABP7O15540 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FABP7O15540 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FABP7O15540 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FABP7O15540 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FABP7O15540 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FABP7O15540 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FABP7O15540 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FABP7O15540 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FABP7O15540 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FABP7O15540 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FABP7O15540 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FABP7O15540 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FABP7O15540 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FABP7O15540 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FABP7O15540 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FABP7O15540 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FABP7O15540 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FABP7O15540 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
FABP7O15540 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FABP7O15540 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FABP7O15540 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FABP7O15540 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FABP7O15540 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FABP7O15540 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FABP7O15540 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FABP7O15540 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FABP7O15540 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FABP7O15540 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FABP7O15540 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FABP7O15540 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FABP7O15540 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FABP7O15540 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FABP7O15540 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FABP7O15540 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FABP7O15540 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FABP7O15540 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FABP7O15540 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FABP7O15540 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FABP7O15540 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FABP7O15540 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FABP7O15540 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FABP7O15540 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FABP7O15540 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FABP7O15540 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FABP7O15540 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FABP7O15540 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FABP7O15540 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FABP7O15540 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FABP7O15540 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FABP7O15540 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FABP7O15540 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FABP7O15540 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FABP7O15540 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FABP7O15540 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FABP7O15540 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FABP7O15540 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FABP7O15540 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FABP7O15540 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FABP7O15540 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FABP7O15540 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FABP7O15540 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FABP7O15540 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FABP7O15540 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FABP7O15540 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FABP7O15540 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FABP7O15540 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FABP7O15540 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FABP7O15540 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FABP7O15540 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FABP7O15540 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FABP7O15540 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FABP7O15540 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FABP7O15540 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FABP7O15540 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FABP7O15540 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FABP7O15540 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FABP7O15540 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FABP7O15540 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FABP7O15540 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FABP7O15540 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FABP7O15540 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FABP7O15540 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FABP7O15540 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FABP7O15540 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FABP7O15540 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FABP7O15540 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FABP7O15540 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FABP7O15540 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms