Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP290O15078 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP290O15078 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP290O15078 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP290O15078 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CEP290O15078 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CEP290O15078 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CEP290O15078 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP290O15078 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP290O15078 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP290O15078 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP290O15078 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP290O15078 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP290O15078 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP290O15078 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP290O15078 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP290O15078 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP290O15078 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP290O15078 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP290O15078 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP290O15078 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP290O15078 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP290O15078 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP290O15078 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP290O15078 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP290O15078 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP290O15078 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP290O15078 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP290O15078 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP290O15078 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP290O15078 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP290O15078 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP290O15078 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP290O15078 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP290O15078 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP290O15078 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP290O15078 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP290O15078 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP290O15078 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP290O15078 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP290O15078 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP290O15078 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP290O15078 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP290O15078 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP290O15078 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP290O15078 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP290O15078 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP290O15078 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP290O15078 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP290O15078 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP290O15078 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP290O15078 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP290O15078 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP290O15078 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP290O15078 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP290O15078 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP290O15078 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP290O15078 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP290O15078 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CEP290O15078 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CEP290O15078 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP290O15078 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CEP290O15078 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CEP290O15078 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CEP290O15078 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CEP290O15078 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP290O15078 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP290O15078 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP290O15078 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP290O15078 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP290O15078 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP290O15078 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP290O15078 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP290O15078 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP290O15078 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP290O15078 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP290O15078 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP290O15078 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP290O15078 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP290O15078 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP290O15078 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP290O15078 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP290O15078 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP290O15078 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP290O15078 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP290O15078 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP290O15078 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CEP290O15078 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CEP290O15078 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP290O15078 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP290O15078 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP290O15078 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP290O15078 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP290O15078 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP290O15078 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP290O15078 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP290O15078 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP290O15078 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP290O15078 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP290O15078 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms