Protein–RNA interactions for Protein: O15020

SPTBN2, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN2O15020 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBN2O15020 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPTBN2O15020 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms