Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms