Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP5A6NIR3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP5A6NIR3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP5A6NIR3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP5A6NIR3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms