Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPDC1A2A3K4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPDC1A2A3K4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPDC1A2A3K4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPDC1A2A3K4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms