Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRGMA1A4Y4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IRGMA1A4Y4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRGMA1A4Y4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRGMA1A4Y4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms