Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX0

CIB4, Calcium and integrin-binding family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB4A0PJX0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIB4A0PJX0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIB4A0PJX0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIB4A0PJX0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIB4A0PJX0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIB4A0PJX0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIB4A0PJX0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CIB4A0PJX0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIB4A0PJX0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIB4A0PJX0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms