RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W SGS1P35187 1447 aa8.49□□□□□ -1.05
YMR196WYMR196W INO80P53115 1489 aa8.36□□□□□ -1.07
YMR196WYMR196W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
YMR196WYMR196W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
YMR196WYMR196W TY1B-DR4Q07793 1604 aa8.23□□□□□ -1.09
YMR196WYMR196W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
YMR196WYMR196W SSN2P38931 1420 aa8.09□□□□□ -1.11
YMR196WYMR196W SWR1Q05471 1514 aa8.05□□□□□ -1.12
YMR196WYMR196W HSL1P34244 1518 aa8.04□□□□□ -1.12
YMR196WYMR196W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
YMR196WYMR196W HIR3P47171 1648 aa7.89□□□□□ -1.15
YMR196WYMR196W DNA2P38859 1522 aa7.82□□□□□ -1.16
YMR196WYMR196W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
YMR196WYMR196W KOG1P38873 1557 aa7.77□□□□□ -1.17
YMR196WYMR196W DRS1P32892 752 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
YMR196WYMR196W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
YMR196WYMR196W REV3P14284 1504 aa7.7□□□□□ -1.18
YMR196WYMR196W SIN3P22579 1536 aa7.66□□□□□ -1.18
YMR196WYMR196W THO2P53552 1597 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
YMR196WYMR196W SSK2P53599 1579 aa7.61□□□□□ -1.19
YMR196WYMR196W BUD4P47136 1447 aa7.61□□□□□ -1.19
YMR196WYMR196W ECM5Q03214 1411 aa7.59□□□□□ -1.19
YMR196WYMR196W ATG2P53855 1592 aa7.56□□□□□ -1.2
YMR196WYMR196W TAF2P23255 1407 aa7.56□□□□□ -1.2
YMR196WYMR196W ESP1Q03018 1630 aa7.54□□□□□ -1.2
YMR196WYMR196W PEP1P32319 1579 aa7.52□□□□□ -1.21
YMR196WYMR196W MDS3P53094 1487 aa7.49□□□□□ -1.21
YMR196WYMR196W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
YMR196WYMR196W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
YMR196WYMR196W YPK9Q12697 1472 aa7.43□□□□□ -1.22
YMR196WYMR196W SCC2Q04002 1493 aa7.37□□□□□ -1.23
YMR196WYMR196W POL1P13382 1468 aa7.37□□□□□ -1.23
YMR196WYMR196W RPO31P04051 1460 aa7.33□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W STU1P38198 1513 aa7.31□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W UFD4P33202 1483 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W RKR1Q04781 1562 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W TY2B-FP0CX63 1770 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W TY2B-CP25384 1770 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W TY2B-DR2Q03494 1770 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W TY1B-DR1Q03855 1755 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W TY2B-OR1Q12113 1770 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W TY2B-DR1Q12472 1770 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W TY2B-OR2Q12501 1770 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YMR196WYMR196W YOR1P53049 1477 aa7.26□□□□□ -1.25
YMR196WYMR196W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YMR196WYMR196W CHD1P32657 1468 aa7.26□□□□□ -1.25
YMR196WYMR196W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YMR196WYMR196W TY1B-DR3Q99231 1755 aa7.24□□□□□ -1.25
YMR196WYMR196W BPT1P14772 1559 aa7.24□□□□□ -1.25
YMR196WYMR196W TAF7Q05021 590 aa7.22□□□□□ -1.25
YMR196WYMR196W TY2B-BQ12491 1770 aa7.22□□□□□ -1.25
YMR196WYMR196W YTA7P40340 1379 aa7.22□□□□□ -1.25
YMR196WYMR196W MMS22Q06164 1454 aa7.22□□□□□ -1.25
YMR196WYMR196W SMC4Q12267 1418 aa7.21□□□□□ -1.25
YMR196WYMR196W TY1B-BRQ12193 1756 aa7.19□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-GR3Q12316 1755 aa7.19□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-ORQ92393 1755 aa7.19□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W MYO4P32492 1471 aa7.18□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-HO13535 1793 aa7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-JR1P47098 1755 aa7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-ER1Q03612 1755 aa7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-GR2Q12269 1755 aa7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-OLQ12273 1755 aa7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YMR196WYMR196W CDC25P04821 1589 aa7.13□□□□□ -1.27
YMR196WYMR196W SPP41P38904 1435 aa7.09□□□□□ -1.27
YMR196WYMR196W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W PAN1P32521 1480 aa7.08□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W TY1B-ER2Q03619 1755 aa7.05□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W TY1B-MR1Q04214 1755 aa7.05□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W TY1B-NL1Q12112 1755 aa7.05□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W TY1B-GR1Q12141 1755 aa7.05□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W TY1B-BLQ12490 1755 aa7.05□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W VTH1P40438 1549 aa7.05□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W VTH2P40890 1549 aa7.05□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W DNF1P32660 1571 aa7.04□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W TSC11P40061 1430 aa7.04□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W MLP2P40457 1679 aa7.04□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YMR196WYMR196W STH1P32597 1359 aa7.02□□□□□ -1.29
YMR196WYMR196W ULS1Q08562 1619 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.6 ms