RNA–Protein interactions for RNA: YKL036C

YKL036C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL036C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL036CYKL036C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
YKL036CYKL036C INO80P53115 1489 aa37.04■■■■□ 3.52
YKL036CYKL036C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
YKL036CYKL036C SWR1Q05471 1514 aa35.57■■■■□ 3.28
YKL036CYKL036C SGS1P35187 1447 aa35.52■■■■□ 3.28
YKL036CYKL036C TY1B-DR4Q07793 1604 aa35.5■■■■□ 3.27
YKL036CYKL036C DNA2P38859 1522 aa35.32■■■■□ 3.25
YKL036CYKL036C KOG1P38873 1557 aa34.95■■■■□ 3.18
YKL036CYKL036C HSL1P34244 1518 aa34.4■■■■□ 3.1
YKL036CYKL036C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
YKL036CYKL036C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
YKL036CYKL036C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
YKL036CYKL036C HIR3P47171 1648 aa33.68■■■□□ 2.98
YKL036CYKL036C ECM5Q03214 1411 aa33.36■■■□□ 2.93
YKL036CYKL036C THO2P53552 1597 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.91
YKL036CYKL036C BUD4P47136 1447 aa33.22■■■□□ 2.91
YKL036CYKL036C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
YKL036CYKL036C SSN2P38931 1420 aa32.96■■■□□ 2.87
YKL036CYKL036C MDS3P53094 1487 aa32.83■■■□□ 2.85
YKL036CYKL036C REV3P14284 1504 aa32.57■■■□□ 2.8
YKL036CYKL036C PEP1P32319 1579 aa32.55■■■□□ 2.8
YKL036CYKL036C ATG2P53855 1592 aa32.47■■■□□ 2.79
YKL036CYKL036C MTC1P47018 478 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
YKL036CYKL036C SIN3P22579 1536 aa32.24■■■□□ 2.75
YKL036CYKL036C TAF2P23255 1407 aa32.16■■■□□ 2.74
YKL036CYKL036C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
YKL036CYKL036C SSK2P53599 1579 aa31.97■■■□□ 2.71
YKL036CYKL036C BPT1P14772 1559 aa31.96■■■□□ 2.71
YKL036CYKL036C DRS1P32892 752 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
YKL036CYKL036C ESP1Q03018 1630 aa31.82■■■□□ 2.68
YKL036CYKL036C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
YKL036CYKL036C YCF1P39109 1515 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
YKL036CYKL036C UFD4P33202 1483 aa31.41■■■□□ 2.62
YKL036CYKL036C YPK9Q12697 1472 aa31.4■■■□□ 2.62
YKL036CYKL036C SCC2Q04002 1493 aa31.31■■■□□ 2.6
YKL036CYKL036C RPO31P04051 1460 aa31.13■■■□□ 2.57
YKL036CYKL036C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa30.91■■■□□ 2.54
YKL036CYKL036C TY2B-FP0CX63 1770 aa30.91■■■□□ 2.54
YKL036CYKL036C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa30.91■■■□□ 2.54
YKL036CYKL036C TY2B-CP25384 1770 aa30.91■■■□□ 2.54
YKL036CYKL036C TY2B-DR2Q03494 1770 aa30.91■■■□□ 2.54
YKL036CYKL036C TY1B-DR1Q03855 1755 aa30.91■■■□□ 2.54
YKL036CYKL036C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
YKL036CYKL036C TY2B-OR1Q12113 1770 aa30.91■■■□□ 2.54
YKL036CYKL036C TY2B-DR1Q12472 1770 aa30.91■■■□□ 2.54
YKL036CYKL036C TY2B-OR2Q12501 1770 aa30.91■■■□□ 2.54
YKL036CYKL036C CDC25P04821 1589 aa30.87■■■□□ 2.53
YKL036CYKL036C CHD1P32657 1468 aa30.84■■■□□ 2.53
YKL036CYKL036C TY1B-BRQ12193 1756 aa30.71■■■□□ 2.51
YKL036CYKL036C TY1B-GR3Q12316 1755 aa30.71■■■□□ 2.51
YKL036CYKL036C TY1B-ORQ92393 1755 aa30.71■■■□□ 2.51
YKL036CYKL036C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
YKL036CYKL036C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
YKL036CYKL036C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
YKL036CYKL036C RKR1Q04781 1562 aa30.62■■■□□ 2.49
YKL036CYKL036C DNF1P32660 1571 aa30.6■■■□□ 2.49
YKL036CYKL036C PAN1P32521 1480 aa30.58■■■□□ 2.49
YKL036CYKL036C POL1P13382 1468 aa30.57■■■□□ 2.48
YKL036CYKL036C TY2B-BQ12491 1770 aa30.54■■■□□ 2.48
YKL036CYKL036C TY1B-DR3Q99231 1755 aa30.5■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C MET5P47169 1442 aa30.49■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-HO13535 1793 aa30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-JR1P47098 1755 aa30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-ER1Q03612 1755 aa30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-GR2Q12269 1755 aa30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-OLQ12273 1755 aa30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
YKL036CYKL036C MMS22Q06164 1454 aa30.38■■■□□ 2.45
YKL036CYKL036C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
YKL036CYKL036C STU1P38198 1513 aa30.32■■■□□ 2.44
YKL036CYKL036C YOR1P53049 1477 aa30.3■■■□□ 2.44
YKL036CYKL036C SMC4Q12267 1418 aa30.28■■■□□ 2.44
YKL036CYKL036C TRM732Q03496 1420 aa30.14■■■□□ 2.42
YKL036CYKL036C LTE1P07866 1435 aa30.09■■■□□ 2.41
YKL036CYKL036C SPP41P38904 1435 aa30.06■■■□□ 2.4
YKL036CYKL036C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
YKL036CYKL036C TY1B-ER2Q03619 1755 aa29.87■■■□□ 2.37
YKL036CYKL036C TY1B-MR1Q04214 1755 aa29.87■■■□□ 2.37
YKL036CYKL036C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
YKL036CYKL036C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
YKL036CYKL036C TY1B-NL1Q12112 1755 aa29.87■■■□□ 2.37
YKL036CYKL036C TY1B-GR1Q12141 1755 aa29.87■■■□□ 2.37
YKL036CYKL036C TY1B-BLQ12490 1755 aa29.87■■■□□ 2.37
YKL036CYKL036C TSC11P40061 1430 aa29.85■■■□□ 2.37
YKL036CYKL036C VTH1P40438 1549 aa29.83■■■□□ 2.37
YKL036CYKL036C VTH2P40890 1549 aa29.83■■■□□ 2.37
YKL036CYKL036C NUP159P40477 1460 aa29.82■■■□□ 2.36
YKL036CYKL036C GEA2P39993 1459 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
YKL036CYKL036C NTE1Q04958 1679 aa29.79■■■□□ 2.36
YKL036CYKL036C YRF1-1P0CX20 1796 aa29.76■■■□□ 2.35
YKL036CYKL036C YRF1-5P0CX21 1796 aa29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.6 ms