RNA–Protein interactions for RNA: YJL075C

APQ13, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene APQ13, Length 417 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APQ13YJL075C MTC1P47018 478 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
APQ13YJL075C DRS1P32892 752 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
APQ13YJL075C FAP1P53971 965 aa12.8□□□□□ -0.36
APQ13YJL075C PRI1P10363 409 aa12.2□□□□□ -0.46
APQ13YJL075C AAD16Q02895 342 aa12.07□□□□□ -0.48
APQ13YJL075C PRY3P47033 881 aa12.05□□□□□ -0.48
APQ13YJL075C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
APQ13YJL075C ISW2Q08773 1120 aa12□□□□□ -0.49
APQ13YJL075C RPG1P38249 964 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
APQ13YJL075C AVT3P36062 692 aa11.72□□□□□ -0.53
APQ13YJL075C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
APQ13YJL075C YCK3P39962 524 aa11.55□□□□□ -0.56
APQ13YJL075C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
APQ13YJL075C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
APQ13YJL075C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
APQ13YJL075C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
APQ13YJL075C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
APQ13YJL075C REB1P21538 810 aa11.07□□□□□ -0.64
APQ13YJL075C MRPL32P25348 183 aa11.02□□□□□ -0.65
APQ13YJL075C SPT21P35209 758 aa10.81□□□□□ -0.68
APQ13YJL075C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
APQ13YJL075C CDC27P38042 758 aa10.59□□□□□ -0.71
APQ13YJL075C YGL015CP33199 130 aa10.53□□□□□ -0.72
APQ13YJL075C RIM101P33400 625 aa10.46□□□□□ -0.73
APQ13YJL075C TFC8Q12308 588 aa10.39□□□□□ -0.75
APQ13YJL075C TFA1P36100 482 aa10.37□□□□□ -0.75
APQ13YJL075C HOP09932 586 aa10.36□□□□□ -0.75
APQ13YJL075C DCD1P06773 312 aa10.31□□□□□ -0.76
APQ13YJL075C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
APQ13YJL075C MAP2P38174 421 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
APQ13YJL075C OXP1P28273 1286 aa10.12□□□□□ -0.79
APQ13YJL075C BCH2P36122 765 aa10.05□□□□□ -0.8
APQ13YJL075C SCY1P53009 804 aa10.02□□□□□ -0.81
APQ13YJL075C SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
APQ13YJL075C PTP3P40048 928 aa9.85□□□□□ -0.83
APQ13YJL075C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
APQ13YJL075C EPS1P40557 701 aa9.8□□□□□ -0.84
APQ13YJL075C BDF1P35817 686 aa9.77□□□□□ -0.85
APQ13YJL075C TGL3P40308 642 aa9.77□□□□□ -0.85
APQ13YJL075C RSM7P47150 247 aa9.77□□□□□ -0.85
APQ13YJL075C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
APQ13YJL075C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
APQ13YJL075C YLR271WQ06152 274 aa9.68□□□□□ -0.86
APQ13YJL075C AI2P03876 854 aa9.66□□□□□ -0.86
APQ13YJL075C BBC1P47068 1157 aa9.61□□□□□ -0.87
APQ13YJL075C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
APQ13YJL075C SSP1P38871 571 aa9.57□□□□□ -0.88
APQ13YJL075C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
APQ13YJL075C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data9.45□□□□□ -0.9not detected
APQ13YJL075C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data9.45□□□□□ -0.9not detected
APQ13YJL075C MST1P07236 462 aa9.44□□□□□ -0.9
APQ13YJL075C UBP9P39967 754 aa9.34□□□□□ -0.91
APQ13YJL075C CST9Q06032 482 aa9.34□□□□□ -0.91
APQ13YJL075C YOR238WQ08634 303 aa9.34□□□□□ -0.91
APQ13YJL075C MGA2P40578 1113 aa9.33□□□□□ -0.92
APQ13YJL075C MRM1P25270 412 aa9.32□□□□□ -0.92
APQ13YJL075C YAP5P40574 245 aa9.31□□□□□ -0.92
APQ13YJL075C YBL029C-AQ3E756 94 aa9.19□□□□□ -0.94
APQ13YJL075C VPS29P38759 282 aa9.16□□□□□ -0.94
APQ13YJL075C RTG3P38165 486 aa9.13□□□□□ -0.95
APQ13YJL075C RCR1P38212 213 aa9.12□□□□□ -0.95
APQ13YJL075C VNX1P42839 908 aa9.12□□□□□ -0.95
APQ13YJL075C PIB1Q06651 286 aa9.11□□□□□ -0.95
APQ13YJL075C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data9.1□□□□□ -0.95not detected
APQ13YJL075C SIS1P25294 352 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
APQ13YJL075C STS1P38637 319 aa9.05□□□□□ -0.96
APQ13YJL075C WSC3Q12215 556 aa9.05□□□□□ -0.96
APQ13YJL075C DBP1P24784 617 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
APQ13YJL075C GTT3P39996 337 aa9.04□□□□□ -0.96
APQ13YJL075C YFR006WP43590 535 aa9.01□□□□□ -0.97
APQ13YJL075C SPP1Q03012 353 aa9□□□□□ -0.97
APQ13YJL075C TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
APQ13YJL075C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
APQ13YJL075C SAM3Q08986 587 aa8.92□□□□□ -0.98
APQ13YJL075C RAM2P29703 316 aa8.91□□□□□ -0.98
APQ13YJL075C YOL036WQ08206 761 aa8.91□□□□□ -0.98
APQ13YJL075C MSB4Q12317 492 aa8.91□□□□□ -0.98
APQ13YJL075C IOC2Q12072 812 aa8.89□□□□□ -0.99
APQ13YJL075C ULI1P43604 169 aa8.86□□□□□ -0.99
APQ13YJL075C SET4P42948 560 aa8.85□□□□□ -0.99
APQ13YJL075C FKH1P40466 484 aa8.84□□□□□ -0.99
APQ13YJL075C MAK11P20484 414 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
APQ13YJL075C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
APQ13YJL075C LDB19Q12502 818 aa8.82□□□□□ -1
APQ13YJL075C EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
APQ13YJL075C TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
APQ13YJL075C EDS1P38073 919 aa8.75□□□□□ -1.01
APQ13YJL075C GYP5Q12344 894 aa8.74□□□□□ -1.01
APQ13YJL075C ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
APQ13YJL075C COQ8P27697 501 aa8.69□□□□□ -1.02
APQ13YJL075C RTG1P32607 177 aa8.69□□□□□ -1.02
APQ13YJL075C MIF2P35201 549 aa8.69□□□□□ -1.02
APQ13YJL075C PTC3P34221 468 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
APQ13YJL075C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
APQ13YJL075C DCW1P36091 449 aa8.66□□□□□ -1.02
APQ13YJL075C DAN4P47179 1161 aa8.66□□□□□ -1.02
APQ13YJL075C HTA1P04911 132 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
APQ13YJL075C HTA2P04912 132 aa8.65□□□□□ -1.02
APQ13YJL075C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
APQ13YJL075C SEC61P32915 480 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.1 ms