RNA–Protein interactions for RNA: YJL055W

YJL055W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YJL055W, Length 738 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL055WYJL055W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
YJL055WYJL055W INO80P53115 1489 aa17.72■□□□□ 0.43
YJL055WYJL055W SGS1P35187 1447 aa17.59■□□□□ 0.41
YJL055WYJL055W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
YJL055WYJL055W TY1B-DR4Q07793 1604 aa17.46■□□□□ 0.39
YJL055WYJL055W SWR1Q05471 1514 aa17.29■□□□□ 0.36
YJL055WYJL055W DNA2P38859 1522 aa16.99■□□□□ 0.31
YJL055WYJL055W HSL1P34244 1518 aa16.93■□□□□ 0.3
YJL055WYJL055W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
YJL055WYJL055W KOG1P38873 1557 aa16.82■□□□□ 0.28
YJL055WYJL055W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
YJL055WYJL055W HIR3P47171 1648 aa16.59■□□□□ 0.25
YJL055WYJL055W SSN2P38931 1420 aa16.53■□□□□ 0.24
YJL055WYJL055W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
YJL055WYJL055W THO2P53552 1597 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
YJL055WYJL055W ECM5Q03214 1411 aa16.18■□□□□ 0.18
YJL055WYJL055W BUD4P47136 1447 aa16.17■□□□□ 0.18
YJL055WYJL055W REV3P14284 1504 aa16.1■□□□□ 0.17
YJL055WYJL055W SIN3P22579 1536 aa15.99■□□□□ 0.15
YJL055WYJL055W MDS3P53094 1487 aa15.98■□□□□ 0.15
YJL055WYJL055W PEP1P32319 1579 aa15.98■□□□□ 0.15
YJL055WYJL055W ATG2P53855 1592 aa15.98■□□□□ 0.15
YJL055WYJL055W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
YJL055WYJL055W SSK2P53599 1579 aa15.87■□□□□ 0.13
YJL055WYJL055W DRS1P32892 752 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
YJL055WYJL055W TAF2P23255 1407 aa15.77■□□□□ 0.12
YJL055WYJL055W ESP1Q03018 1630 aa15.76■□□□□ 0.11
YJL055WYJL055W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
YJL055WYJL055W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
YJL055WYJL055W YPK9Q12697 1472 aa15.51■□□□□ 0.07
YJL055WYJL055W BPT1P14772 1559 aa15.49■□□□□ 0.07
YJL055WYJL055W SCC2Q04002 1493 aa15.45■□□□□ 0.06
YJL055WYJL055W UFD4P33202 1483 aa15.37■□□□□ 0.05
YJL055WYJL055W RPO31P04051 1460 aa15.36■□□□□ 0.05
YJL055WYJL055W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa15.31■□□□□ 0.04
YJL055WYJL055W TY2B-FP0CX63 1770 aa15.31■□□□□ 0.04
YJL055WYJL055W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa15.31■□□□□ 0.04
YJL055WYJL055W TY2B-CP25384 1770 aa15.31■□□□□ 0.04
YJL055WYJL055W TY2B-DR2Q03494 1770 aa15.31■□□□□ 0.04
YJL055WYJL055W TY1B-DR1Q03855 1755 aa15.31■□□□□ 0.04
YJL055WYJL055W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
YJL055WYJL055W TY2B-OR1Q12113 1770 aa15.31■□□□□ 0.04
YJL055WYJL055W TY2B-DR1Q12472 1770 aa15.31■□□□□ 0.04
YJL055WYJL055W TY2B-OR2Q12501 1770 aa15.31■□□□□ 0.04
YJL055WYJL055W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
YJL055WYJL055W MTC1P47018 478 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
YJL055WYJL055W POL1P13382 1468 aa15.2■□□□□ 0.02
YJL055WYJL055W TY1B-BRQ12193 1756 aa15.17■□□□□ 0.02
YJL055WYJL055W TY1B-GR3Q12316 1755 aa15.17■□□□□ 0.02
YJL055WYJL055W TY1B-ORQ92393 1755 aa15.17■□□□□ 0.02
YJL055WYJL055W TY1B-DR3Q99231 1755 aa15.16■□□□□ 0.02
YJL055WYJL055W RKR1Q04781 1562 aa15.16■□□□□ 0.02
YJL055WYJL055W TY2B-BQ12491 1770 aa15.15■□□□□ 0.02
YJL055WYJL055W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W CDC25P04821 1589 aa15.11■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-HO13535 1793 aa15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-JR1P47098 1755 aa15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-ER1Q03612 1755 aa15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-GR2Q12269 1755 aa15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-OLQ12273 1755 aa15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
YJL055WYJL055W STU1P38198 1513 aa15.07■□□□□ 0
YJL055WYJL055W CHD1P32657 1468 aa15.07■□□□□ 0
YJL055WYJL055W YOR1P53049 1477 aa15.03■□□□□ -0
YJL055WYJL055W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
YJL055WYJL055W SMC4Q12267 1418 aa14.98□□□□□ -0.01
YJL055WYJL055W DNF1P32660 1571 aa14.98□□□□□ -0.01
YJL055WYJL055W PAN1P32521 1480 aa14.95□□□□□ -0.02
YJL055WYJL055W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
YJL055WYJL055W MMS22Q06164 1454 aa14.89□□□□□ -0.03
YJL055WYJL055W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
YJL055WYJL055W TY1B-ER2Q03619 1755 aa14.8□□□□□ -0.04
YJL055WYJL055W TY1B-MR1Q04214 1755 aa14.8□□□□□ -0.04
YJL055WYJL055W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
YJL055WYJL055W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
YJL055WYJL055W TY1B-NL1Q12112 1755 aa14.8□□□□□ -0.04
YJL055WYJL055W TY1B-GR1Q12141 1755 aa14.8□□□□□ -0.04
YJL055WYJL055W TY1B-BLQ12490 1755 aa14.8□□□□□ -0.04
YJL055WYJL055W SPP41P38904 1435 aa14.8□□□□□ -0.04
YJL055WYJL055W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
YJL055WYJL055W MYO4P32492 1471 aa14.77□□□□□ -0.04
YJL055WYJL055W YTA7P40340 1379 aa14.75□□□□□ -0.05
YJL055WYJL055W MET5P47169 1442 aa14.75□□□□□ -0.05
YJL055WYJL055W VTH1P40438 1549 aa14.71□□□□□ -0.05
YJL055WYJL055W VTH2P40890 1549 aa14.71□□□□□ -0.05
YJL055WYJL055W TSC11P40061 1430 aa14.69□□□□□ -0.06
YJL055WYJL055W NTE1Q04958 1679 aa14.68□□□□□ -0.06
YJL055WYJL055W TRM732Q03496 1420 aa14.67□□□□□ -0.06
YJL055WYJL055W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
YJL055WYJL055W YRF1-1P0CX20 1796 aa14.62□□□□□ -0.07
YJL055WYJL055W YRF1-5P0CX21 1796 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.4 ms