RNA–Protein interactions for RNA: YGL063W

PUS2, Transcript of Mitochondrial tRNA:pseudouridine synthase, yeastyeast

Gene PUS2, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS2YGL063W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PUS2YGL063W INO80P53115 1489 aa25.12■■□□□ 1.61
PUS2YGL063W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PUS2YGL063W SWR1Q05471 1514 aa24.06■■□□□ 1.44
PUS2YGL063W TY1B-DR4Q07793 1604 aa23.98■■□□□ 1.43
PUS2YGL063W DNA2P38859 1522 aa23.96■■□□□ 1.43
PUS2YGL063W SGS1P35187 1447 aa23.91■■□□□ 1.42
PUS2YGL063W KOG1P38873 1557 aa23.65■■□□□ 1.38
PUS2YGL063W HSL1P34244 1518 aa23.18■■□□□ 1.3
PUS2YGL063W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PUS2YGL063W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PUS2YGL063W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PUS2YGL063W HIR3P47171 1648 aa22.7■■□□□ 1.22
PUS2YGL063W ECM5Q03214 1411 aa22.57■■□□□ 1.2
PUS2YGL063W THO2P53552 1597 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PUS2YGL063W BUD4P47136 1447 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS2YGL063W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PUS2YGL063W MDS3P53094 1487 aa22.15■■□□□ 1.14
PUS2YGL063W SSN2P38931 1420 aa22.11■■□□□ 1.13
PUS2YGL063W PEP1P32319 1579 aa22■■□□□ 1.11
PUS2YGL063W REV3P14284 1504 aa21.9■■□□□ 1.1
PUS2YGL063W ATG2P53855 1592 aa21.89■■□□□ 1.09
PUS2YGL063W MTC1P47018 478 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PUS2YGL063W SIN3P22579 1536 aa21.67■■□□□ 1.06
PUS2YGL063W TAF2P23255 1407 aa21.63■■□□□ 1.05
PUS2YGL063W BPT1P14772 1559 aa21.57■■□□□ 1.04
PUS2YGL063W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PUS2YGL063W SSK2P53599 1579 aa21.48■■□□□ 1.03
PUS2YGL063W ESP1Q03018 1630 aa21.39■■□□□ 1.01
PUS2YGL063W DRS1P32892 752 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PUS2YGL063W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
PUS2YGL063W UFD4P33202 1483 aa21.17■□□□□ 0.98
PUS2YGL063W YPK9Q12697 1472 aa21.13■□□□□ 0.97
PUS2YGL063W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PUS2YGL063W SCC2Q04002 1493 aa21.08■□□□□ 0.97
PUS2YGL063W RPO31P04051 1460 aa20.98■□□□□ 0.95
PUS2YGL063W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa20.82■□□□□ 0.92
PUS2YGL063W TY2B-FP0CX63 1770 aa20.82■□□□□ 0.92
PUS2YGL063W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa20.82■□□□□ 0.92
PUS2YGL063W TY2B-CP25384 1770 aa20.82■□□□□ 0.92
PUS2YGL063W TY2B-DR2Q03494 1770 aa20.82■□□□□ 0.92
PUS2YGL063W TY1B-DR1Q03855 1755 aa20.82■□□□□ 0.92
PUS2YGL063W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PUS2YGL063W TY2B-OR1Q12113 1770 aa20.82■□□□□ 0.92
PUS2YGL063W TY2B-DR1Q12472 1770 aa20.82■□□□□ 0.92
PUS2YGL063W TY2B-OR2Q12501 1770 aa20.82■□□□□ 0.92
PUS2YGL063W CHD1P32657 1468 aa20.81■□□□□ 0.92
PUS2YGL063W CDC25P04821 1589 aa20.8■□□□□ 0.92
PUS2YGL063W TY1B-BRQ12193 1756 aa20.72■□□□□ 0.91
PUS2YGL063W TY1B-GR3Q12316 1755 aa20.72■□□□□ 0.91
PUS2YGL063W TY1B-ORQ92393 1755 aa20.72■□□□□ 0.91
PUS2YGL063W DNF1P32660 1571 aa20.68■□□□□ 0.9
PUS2YGL063W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PUS2YGL063W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
PUS2YGL063W MET5P47169 1442 aa20.63■□□□□ 0.89
PUS2YGL063W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PUS2YGL063W PAN1P32521 1480 aa20.62■□□□□ 0.89
PUS2YGL063W TY2B-BQ12491 1770 aa20.57■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W RKR1Q04781 1562 aa20.55■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-DR3Q99231 1755 aa20.54■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-HO13535 1793 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-JR1P47098 1755 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-ER1Q03612 1755 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-GR2Q12269 1755 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-OLQ12273 1755 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W POL1P13382 1468 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS2YGL063W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PUS2YGL063W MMS22Q06164 1454 aa20.44■□□□□ 0.86
PUS2YGL063W LTE1P07866 1435 aa20.36■□□□□ 0.85
PUS2YGL063W SMC4Q12267 1418 aa20.35■□□□□ 0.85
PUS2YGL063W STU1P38198 1513 aa20.34■□□□□ 0.85
PUS2YGL063W YOR1P53049 1477 aa20.34■□□□□ 0.85
PUS2YGL063W TRM732Q03496 1420 aa20.28■□□□□ 0.84
PUS2YGL063W SPP41P38904 1435 aa20.22■□□□□ 0.83
PUS2YGL063W BNI1P41832 1953 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS2YGL063W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PUS2YGL063W TY1B-ER2Q03619 1755 aa20.13■□□□□ 0.81
PUS2YGL063W TY1B-MR1Q04214 1755 aa20.13■□□□□ 0.81
PUS2YGL063W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PUS2YGL063W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PUS2YGL063W TY1B-NL1Q12112 1755 aa20.13■□□□□ 0.81
PUS2YGL063W TY1B-GR1Q12141 1755 aa20.13■□□□□ 0.81
PUS2YGL063W TY1B-BLQ12490 1755 aa20.13■□□□□ 0.81
PUS2YGL063W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PUS2YGL063W YRF1-1P0CX20 1796 aa20.1■□□□□ 0.81
PUS2YGL063W YRF1-5P0CX21 1796 aa20.1■□□□□ 0.81
PUS2YGL063W YRF1-8P0CX22 1796 aa20.1■□□□□ 0.81
PUS2YGL063W NUP159P40477 1460 aa20.1■□□□□ 0.81
PUS2YGL063W TSC11P40061 1430 aa20.09■□□□□ 0.81
PUS2YGL063W VTH1P40438 1549 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 187.4 ms