RNA–Protein interactions for RNA: YDL057W

YDL057W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YDL057W, Length 987 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL057WYDL057W MTC1P47018 478 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
YDL057WYDL057W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
YDL057WYDL057W DRS1P32892 752 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
YDL057WYDL057W INO80P53115 1489 aa12.13□□□□□ -0.47
YDL057WYDL057W FAP1P53971 965 aa12.1□□□□□ -0.47
YDL057WYDL057W DNA2P38859 1522 aa11.55□□□□□ -0.56
YDL057WYDL057W SWR1Q05471 1514 aa11.45□□□□□ -0.58
YDL057WYDL057W KOG1P38873 1557 aa11.41□□□□□ -0.58
YDL057WYDL057W PRY3P47033 881 aa11.39□□□□□ -0.59
YDL057WYDL057W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
YDL057WYDL057W TY1B-DR4Q07793 1604 aa11.26□□□□□ -0.61
YDL057WYDL057W PRI1P10363 409 aa11.24□□□□□ -0.61
YDL057WYDL057W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
YDL057WYDL057W AAD16Q02895 342 aa11.18□□□□□ -0.62
YDL057WYDL057W ISW2Q08773 1120 aa10.96□□□□□ -0.65
YDL057WYDL057W RPG1P38249 964 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
YDL057WYDL057W YCK3P39962 524 aa10.81□□□□□ -0.68
YDL057WYDL057W SGS1P35187 1447 aa10.79□□□□□ -0.68
YDL057WYDL057W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
YDL057WYDL057W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
YDL057WYDL057W HSL1P34244 1518 aa10.74□□□□□ -0.69
YDL057WYDL057W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
YDL057WYDL057W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
YDL057WYDL057W ECM5Q03214 1411 aa10.63□□□□□ -0.71
YDL057WYDL057W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
YDL057WYDL057W THO2P53552 1597 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
YDL057WYDL057W BUD4P47136 1447 aa10.51□□□□□ -0.73
YDL057WYDL057W HIR3P47171 1648 aa10.5□□□□□ -0.73
YDL057WYDL057W MDS3P53094 1487 aa10.44□□□□□ -0.74
YDL057WYDL057W REV3P14284 1504 aa10.36□□□□□ -0.75
YDL057WYDL057W PEP1P32319 1579 aa10.33□□□□□ -0.76
YDL057WYDL057W AVT3P36062 692 aa10.32□□□□□ -0.76
YDL057WYDL057W BPT1P14772 1559 aa10.23□□□□□ -0.77
YDL057WYDL057W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
YDL057WYDL057W ATG2P53855 1592 aa10.21□□□□□ -0.78
YDL057WYDL057W MRPL32P25348 183 aa10.18□□□□□ -0.78
YDL057WYDL057W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
YDL057WYDL057W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
YDL057WYDL057W REB1P21538 810 aa10.07□□□□□ -0.8
YDL057WYDL057W SSK2P53599 1579 aa10.05□□□□□ -0.8
YDL057WYDL057W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
YDL057WYDL057W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
YDL057WYDL057W MIF2P35201 549 aa9.99□□□□□ -0.81
YDL057WYDL057W SIN3P22579 1536 aa9.93□□□□□ -0.82
YDL057WYDL057W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
YDL057WYDL057W TAF2P23255 1407 aa9.87□□□□□ -0.83
YDL057WYDL057W ESP1Q03018 1630 aa9.84□□□□□ -0.83
YDL057WYDL057W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
YDL057WYDL057W MET5P47169 1442 aa9.82□□□□□ -0.84
YDL057WYDL057W UFD4P33202 1483 aa9.8□□□□□ -0.84
YDL057WYDL057W YGL015CP33199 130 aa9.78□□□□□ -0.84
YDL057WYDL057W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
YDL057WYDL057W LTE1P07866 1435 aa9.75□□□□□ -0.85
YDL057WYDL057W SSN2P38931 1420 aa9.75□□□□□ -0.85
YDL057WYDL057W CDC25P04821 1589 aa9.74□□□□□ -0.85
YDL057WYDL057W BNI1P41832 1953 aa9.72□□□□□ -0.85
YDL057WYDL057W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
YDL057WYDL057W CDC27P38042 758 aa9.71□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W SCC2Q04002 1493 aa9.7□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W DNF1P32660 1571 aa9.7□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W CHD1P32657 1468 aa9.69□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W SPT21P35209 758 aa9.69□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W YPK9Q12697 1472 aa9.68□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W TY1B-BRQ12193 1756 aa9.68□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W TY1B-GR3Q12316 1755 aa9.68□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W TY1B-ORQ92393 1755 aa9.68□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W RKR1Q04781 1562 aa9.67□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa9.67□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W TY2B-FP0CX63 1770 aa9.67□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa9.67□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W TY2B-CP25384 1770 aa9.67□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W TY2B-DR2Q03494 1770 aa9.67□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W TY1B-DR1Q03855 1755 aa9.67□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W TY2B-OR1Q12113 1770 aa9.67□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W TY2B-DR1Q12472 1770 aa9.67□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W TY2B-OR2Q12501 1770 aa9.67□□□□□ -0.86
YDL057WYDL057W RPO31P04051 1460 aa9.64□□□□□ -0.87
YDL057WYDL057W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
YDL057WYDL057W PAN1P32521 1480 aa9.61□□□□□ -0.87
YDL057WYDL057W YFR006WP43590 535 aa9.61□□□□□ -0.87
YDL057WYDL057W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
YDL057WYDL057W ABP1P15891 592 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W ITT1Q04638 464 aa9.56□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-HO13535 1793 aa9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-JR1P47098 1755 aa9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-ER1Q03612 1755 aa9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-GR2Q12269 1755 aa9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-OLQ12273 1755 aa9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
YDL057WYDL057W TY2B-BQ12491 1770 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.9 ms