RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W SGS1P35187 1447 aa20.62■□□□□ 0.89
RNQ1YCL028W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RNQ1YCL028W INO80P53115 1489 aa20.37■□□□□ 0.85
RNQ1YCL028W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RNQ1YCL028W TY1B-DR4Q07793 1604 aa19.97■□□□□ 0.79
RNQ1YCL028W SWR1Q05471 1514 aa19.78■□□□□ 0.76
RNQ1YCL028W HSL1P34244 1518 aa19.54■□□□□ 0.72
RNQ1YCL028W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
RNQ1YCL028W SSN2P38931 1420 aa19.44■□□□□ 0.7
RNQ1YCL028W DNA2P38859 1522 aa19.44■□□□□ 0.7
RNQ1YCL028W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
RNQ1YCL028W KOG1P38873 1557 aa19.29■□□□□ 0.68
RNQ1YCL028W HIR3P47171 1648 aa19.17■□□□□ 0.66
RNQ1YCL028W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
RNQ1YCL028W DRS1P32892 752 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
RNQ1YCL028W ECM5Q03214 1411 aa18.73■□□□□ 0.59
RNQ1YCL028W BUD4P47136 1447 aa18.7■□□□□ 0.58
RNQ1YCL028W REV3P14284 1504 aa18.69■□□□□ 0.58
RNQ1YCL028W THO2P53552 1597 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
RNQ1YCL028W TAF2P23255 1407 aa18.53■□□□□ 0.56
RNQ1YCL028W SIN3P22579 1536 aa18.5■□□□□ 0.55
RNQ1YCL028W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
RNQ1YCL028W MDS3P53094 1487 aa18.39■□□□□ 0.54
RNQ1YCL028W SSK2P53599 1579 aa18.38■□□□□ 0.53
RNQ1YCL028W ATG2P53855 1592 aa18.36■□□□□ 0.53
RNQ1YCL028W MTC1P47018 478 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
RNQ1YCL028W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
RNQ1YCL028W PEP1P32319 1579 aa18.3■□□□□ 0.52
RNQ1YCL028W ESP1Q03018 1630 aa18.23■□□□□ 0.51
RNQ1YCL028W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
RNQ1YCL028W YPK9Q12697 1472 aa18.02■□□□□ 0.48
RNQ1YCL028W SCC2Q04002 1493 aa17.91■□□□□ 0.46
RNQ1YCL028W UFD4P33202 1483 aa17.88■□□□□ 0.45
RNQ1YCL028W BPT1P14772 1559 aa17.85■□□□□ 0.45
RNQ1YCL028W RPO31P04051 1460 aa17.82■□□□□ 0.44
RNQ1YCL028W POL1P13382 1468 aa17.78■□□□□ 0.44
RNQ1YCL028W STU1P38198 1513 aa17.7■□□□□ 0.42
RNQ1YCL028W RKR1Q04781 1562 aa17.68■□□□□ 0.42
RNQ1YCL028W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
RNQ1YCL028W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
RNQ1YCL028W YOR1P53049 1477 aa17.57■□□□□ 0.4
RNQ1YCL028W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
RNQ1YCL028W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa17.55■□□□□ 0.4
RNQ1YCL028W TY2B-FP0CX63 1770 aa17.55■□□□□ 0.4
RNQ1YCL028W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa17.55■□□□□ 0.4
RNQ1YCL028W TY2B-CP25384 1770 aa17.55■□□□□ 0.4
RNQ1YCL028W TY2B-DR2Q03494 1770 aa17.55■□□□□ 0.4
RNQ1YCL028W TY1B-DR1Q03855 1755 aa17.55■□□□□ 0.4
RNQ1YCL028W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
RNQ1YCL028W TY2B-OR1Q12113 1770 aa17.55■□□□□ 0.4
RNQ1YCL028W TY2B-DR1Q12472 1770 aa17.55■□□□□ 0.4
RNQ1YCL028W TY2B-OR2Q12501 1770 aa17.55■□□□□ 0.4
RNQ1YCL028W SMC4Q12267 1418 aa17.51■□□□□ 0.39
RNQ1YCL028W YTA7P40340 1379 aa17.5■□□□□ 0.39
RNQ1YCL028W CHD1P32657 1468 aa17.45■□□□□ 0.38
RNQ1YCL028W CDC25P04821 1589 aa17.42■□□□□ 0.38
RNQ1YCL028W TY1B-DR3Q99231 1755 aa17.4■□□□□ 0.38
RNQ1YCL028W TY2B-BQ12491 1770 aa17.37■□□□□ 0.37
RNQ1YCL028W MMS22Q06164 1454 aa17.36■□□□□ 0.37
RNQ1YCL028W TY1B-BRQ12193 1756 aa17.35■□□□□ 0.37
RNQ1YCL028W TY1B-GR3Q12316 1755 aa17.35■□□□□ 0.37
RNQ1YCL028W TY1B-ORQ92393 1755 aa17.35■□□□□ 0.37
RNQ1YCL028W PAN1P32521 1480 aa17.34■□□□□ 0.37
RNQ1YCL028W MYO4P32492 1471 aa17.32■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W SPP41P38904 1435 aa17.29■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-HO13535 1793 aa17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-JR1P47098 1755 aa17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-ER1Q03612 1755 aa17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-GR2Q12269 1755 aa17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-OLQ12273 1755 aa17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
RNQ1YCL028W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
RNQ1YCL028W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
RNQ1YCL028W DNF1P32660 1571 aa17.19■□□□□ 0.34
RNQ1YCL028W TSC11P40061 1430 aa17.16■□□□□ 0.34
RNQ1YCL028W TRM732Q03496 1420 aa17.15■□□□□ 0.34
RNQ1YCL028W VTH1P40438 1549 aa17.12■□□□□ 0.33
RNQ1YCL028W VTH2P40890 1549 aa17.12■□□□□ 0.33
RNQ1YCL028W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
RNQ1YCL028W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
RNQ1YCL028W STH1P32597 1359 aa17.08■□□□□ 0.32
RNQ1YCL028W TAF7Q05021 590 aa17.03■□□□□ 0.32
RNQ1YCL028W MET5P47169 1442 aa17■□□□□ 0.31
RNQ1YCL028W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
RNQ1YCL028W TY1B-ER2Q03619 1755 aa16.97■□□□□ 0.31
RNQ1YCL028W TY1B-MR1Q04214 1755 aa16.97■□□□□ 0.31
RNQ1YCL028W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
RNQ1YCL028W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
RNQ1YCL028W TY1B-NL1Q12112 1755 aa16.97■□□□□ 0.31
RNQ1YCL028W TY1B-GR1Q12141 1755 aa16.97■□□□□ 0.31
RNQ1YCL028W TY1B-BLQ12490 1755 aa16.97■□□□□ 0.31
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