RNA–Protein interactions for RNA: Q0297

Q0297, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0297, Length 156 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0297Q0297 INO80P53115 1489 aa34.16■■■■□ 3.06
Q0297Q0297 MON2P48563 1636 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
Q0297Q0297 SGS1P35187 1447 aa33.19■■■□□ 2.9
Q0297Q0297 TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
Q0297Q0297 TY1B-DR4Q07793 1604 aa32.89■■■□□ 2.86
Q0297Q0297 SWR1Q05471 1514 aa32.87■■■□□ 2.85
Q0297Q0297 DNA2P38859 1522 aa32.56■■■□□ 2.8
Q0297Q0297 KOG1P38873 1557 aa32.21■■■□□ 2.75
Q0297Q0297 HSL1P34244 1518 aa31.95■■■□□ 2.71
Q0297Q0297 SPT6P23615 1451 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
Q0297Q0297 SPA2P23201 1466 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
Q0297Q0297 HIR3P47171 1648 aa31.31■■■□□ 2.6
Q0297Q0297 RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
Q0297Q0297 SSN2P38931 1420 aa30.92■■■□□ 2.54
Q0297Q0297 ECM5Q03214 1411 aa30.92■■■□□ 2.54
Q0297Q0297 XRN1P22147 1528 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
Q0297Q0297 BUD4P47136 1447 aa30.79■■■□□ 2.52
Q0297Q0297 THO2P53552 1597 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
Q0297Q0297 MDS3P53094 1487 aa30.39■■■□□ 2.46
Q0297Q0297 REV3P14284 1504 aa30.34■■■□□ 2.45
Q0297Q0297 PEP1P32319 1579 aa30.14■■■□□ 2.42
Q0297Q0297 ATG2P53855 1592 aa30.13■■■□□ 2.41
Q0297Q0297 TAF2P23255 1407 aa30.05■■■□□ 2.4
Q0297Q0297 DRS1P32892 752 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
Q0297Q0297 SIN3P22579 1536 aa29.99■■■□□ 2.39
Q0297Q0297 MTC1P47018 478 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
Q0297Q0297 SKI3P17883 1432 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
Q0297Q0297 SSK2P53599 1579 aa29.78■■■□□ 2.36
Q0297Q0297 ESP1Q03018 1630 aa29.63■■■□□ 2.33
Q0297Q0297 BPT1P14772 1559 aa29.58■■■□□ 2.33
Q0297Q0297 MYO2P19524 1574 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
Q0297Q0297 YPK9Q12697 1472 aa29.23■■■□□ 2.27
Q0297Q0297 UFD4P33202 1483 aa29.21■■■□□ 2.27
Q0297Q0297 SCC2Q04002 1493 aa29.13■■■□□ 2.25
Q0297Q0297 YCF1P39109 1515 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
Q0297Q0297 RPO31P04051 1460 aa28.95■■■□□ 2.22
Q0297Q0297 TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa28.73■■■□□ 2.19
Q0297Q0297 TY2B-FP0CX63 1770 aa28.73■■■□□ 2.19
Q0297Q0297 TY2B-GR2P0CX64 1770 aa28.73■■■□□ 2.19
Q0297Q0297 TY2B-CP25384 1770 aa28.73■■■□□ 2.19
Q0297Q0297 TY2B-DR2Q03494 1770 aa28.73■■■□□ 2.19
Q0297Q0297 TY1B-DR1Q03855 1755 aa28.73■■■□□ 2.19
Q0297Q0297 TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
Q0297Q0297 TY2B-OR1Q12113 1770 aa28.73■■■□□ 2.19
Q0297Q0297 TY2B-DR1Q12472 1770 aa28.73■■■□□ 2.19
Q0297Q0297 TY2B-OR2Q12501 1770 aa28.73■■■□□ 2.19
Q0297Q0297 RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
Q0297Q0297 CDC25P04821 1589 aa28.63■■■□□ 2.17
Q0297Q0297 CHD1P32657 1468 aa28.61■■■□□ 2.17
Q0297Q0297 TOP2P06786 1428 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
Q0297Q0297 RKR1Q04781 1562 aa28.58■■■□□ 2.17
Q0297Q0297 POL1P13382 1468 aa28.55■■■□□ 2.16
Q0297Q0297 TY1B-BRQ12193 1756 aa28.52■■■□□ 2.16
Q0297Q0297 TY1B-GR3Q12316 1755 aa28.52■■■□□ 2.16
Q0297Q0297 TY1B-ORQ92393 1755 aa28.52■■■□□ 2.16
Q0297Q0297 ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
Q0297Q0297 TY2B-BQ12491 1770 aa28.41■■■□□ 2.14
Q0297Q0297 TY1B-DR3Q99231 1755 aa28.39■■■□□ 2.14
Q0297Q0297 STU1P38198 1513 aa28.39■■■□□ 2.14
Q0297Q0297 PAN1P32521 1480 aa28.39■■■□□ 2.13
Q0297Q0297 DNF1P32660 1571 aa28.36■■■□□ 2.13
Q0297Q0297 TY1B-HO13535 1793 aa28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 TY1B-JR1P47098 1755 aa28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 TY1B-ER1Q03612 1755 aa28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 TY1B-GR2Q12269 1755 aa28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 TY1B-OLQ12273 1755 aa28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 YOR1P53049 1477 aa28.29■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 MMS22Q06164 1454 aa28.27■■■□□ 2.12
Q0297Q0297 SMC4Q12267 1418 aa28.23■■■□□ 2.11
Q0297Q0297 MET5P47169 1442 aa28.16■■■□□ 2.1
Q0297Q0297 RPA190P10964 1664 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
Q0297Q0297 TRM732Q03496 1420 aa28.03■■■□□ 2.08
Q0297Q0297 SPP41P38904 1435 aa28.02■■■□□ 2.08
Q0297Q0297 YTA7P40340 1379 aa27.86■■■□□ 2.05
Q0297Q0297 TSC11P40061 1430 aa27.81■■■□□ 2.04
Q0297Q0297 VTH1P40438 1549 aa27.79■■■□□ 2.04
Q0297Q0297 VTH2P40890 1549 aa27.79■■■□□ 2.04
Q0297Q0297 TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
Q0297Q0297 TY1B-ER2Q03619 1755 aa27.78■■■□□ 2.04
Q0297Q0297 TY1B-MR1Q04214 1755 aa27.78■■■□□ 2.04
Q0297Q0297 TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
Q0297Q0297 TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
Q0297Q0297 TY1B-NL1Q12112 1755 aa27.78■■■□□ 2.04
Q0297Q0297 TY1B-GR1Q12141 1755 aa27.78■■■□□ 2.04
Q0297Q0297 TY1B-BLQ12490 1755 aa27.78■■■□□ 2.04
Q0297Q0297 LTE1P07866 1435 aa27.76■■■□□ 2.04
Q0297Q0297 MYO4P32492 1471 aa27.74■■■□□ 2.03
Q0297Q0297 NUP159P40477 1460 aa27.7■■■□□ 2.03
Q0297Q0297 NTE1Q04958 1679 aa27.68■■■□□ 2.02
Q0297Q0297 YRF1-1P0CX20 1796 aa27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9 ms