RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639649.1

EPM2A-220, Transcript of EPM2A, laforin glucan phosphatase, humanhuman

Gene EPM2A, Length 849 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPM2A-220ENST00000639649 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.57■■■■■ 6.33
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EPM2A-220ENST00000639649 ABCC9O60706 1549 aa47.86■■■■■ 5.25
EPM2A-220ENST00000639649 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.91■■■■■ 4.94
EPM2A-220ENST00000639649 NACADO15069 1562 aa45.8■■■■■ 4.92
EPM2A-220ENST00000639649 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.78■■■■■ 4.92
EPM2A-220ENST00000639649 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.45■■■■■ 4.87
EPM2A-220ENST00000639649 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.38■■■■■ 4.86
EPM2A-220ENST00000639649 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.15■■■■■ 4.82
EPM2A-220ENST00000639649 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.75■■■■■ 4.75
EPM2A-220ENST00000639649 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.72■■■■■ 4.75
EPM2A-220ENST00000639649 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.49■■■■■ 4.71
EPM2A-220ENST00000639649 SCRIBQ14160 1630 aa44.32■■■■■ 4.68
EPM2A-220ENST00000639649 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.2■■■■■ 4.67
EPM2A-220ENST00000639649 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.05■■■■■ 4.64
EPM2A-220ENST00000639649 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
EPM2A-220ENST00000639649 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.25■■■■■ 4.51
EPM2A-220ENST00000639649 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.05■■■■■ 4.48
EPM2A-220ENST00000639649 SMARCA4P51532 1647 aa42.37■■■■■ 4.37
EPM2A-220ENST00000639649 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
EPM2A-220ENST00000639649 NCAPD3P42695 1498 aa42.3■■■■■ 4.36
EPM2A-220ENST00000639649 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.25■■■■■ 4.35
EPM2A-220ENST00000639649 SMARCA2P51531 1590 aa42.18■■■■■ 4.34
EPM2A-220ENST00000639649 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.04■■■■■ 4.32
EPM2A-220ENST00000639649 HMGXB3Q12766 1538 aa42.01■■■■■ 4.32
EPM2A-220ENST00000639649 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.97■■■■■ 4.31
EPM2A-220ENST00000639649 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
EPM2A-220ENST00000639649 WIZO95785 1651 aa41.54■■■■■ 4.24
EPM2A-220ENST00000639649 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
EPM2A-220ENST00000639649 NESP48681 1621 aa41.32■■■■■ 4.2
EPM2A-220ENST00000639649 ERCC6Q03468 1493 aa41.3■■■■■ 4.2
EPM2A-220ENST00000639649 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.18■■■■■ 4.18
EPM2A-220ENST00000639649 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
EPM2A-220ENST00000639649 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.06■■■■■ 4.16
EPM2A-220ENST00000639649 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.97■■■■■ 4.15
EPM2A-220ENST00000639649 CUX2O14529 1486 aa40.95■■■■■ 4.15
EPM2A-220ENST00000639649 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.76■■■■■ 4.12
EPM2A-220ENST00000639649 CFTRP13569 1480 aa40.74■■■■■ 4.11
EPM2A-220ENST00000639649 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
EPM2A-220ENST00000639649 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.65■■■■■ 4.1
EPM2A-220ENST00000639649 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.56■■■■■ 4.08
EPM2A-220ENST00000639649 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.53■■■■■ 4.08
EPM2A-220ENST00000639649 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.53■■■■■ 4.08
EPM2A-220ENST00000639649 WDR62O43379 1518 aa40.38■■■■■ 4.06
EPM2A-220ENST00000639649 PRDM2Q13029 1718 aa40.28■■■■■ 4.04
EPM2A-220ENST00000639649 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
EPM2A-220ENST00000639649 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
EPM2A-220ENST00000639649 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.07■■■■■ 4.01
EPM2A-220ENST00000639649 ABCC8Q09428 1581 aa39.89■■■■□ 3.98
EPM2A-220ENST00000639649 TOPBP1Q92547 1522 aa39.86■■■■□ 3.97
EPM2A-220ENST00000639649 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.78■■■■□ 3.96
EPM2A-220ENST00000639649 IFT140Q96RY7 1462 aa39.71■■■■□ 3.95
EPM2A-220ENST00000639649 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
EPM2A-220ENST00000639649 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
EPM2A-220ENST00000639649 CUX1P39880 1505 aa39.45■■■■□ 3.91
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EPM2A-220ENST00000639649 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.37■■■■□ 3.89
EPM2A-220ENST00000639649 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.35■■■■□ 3.89
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EPM2A-220ENST00000639649 OSCARQ8IYS5 282 aa39.27■■■■□ 3.88
EPM2A-220ENST00000639649 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.2■■■■□ 3.87
EPM2A-220ENST00000639649 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.14■■■■□ 3.86
EPM2A-220ENST00000639649 WDR97A6NE52 1622 aa39.11■■■■□ 3.85
EPM2A-220ENST00000639649 TOP2BQ02880 1626 aa39.03■■■■□ 3.84
EPM2A-220ENST00000639649 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39■■■■□ 3.83
EPM2A-220ENST00000639649 SYNJ1O43426 1573 aa38.99■■■■□ 3.83
EPM2A-220ENST00000639649 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.99■■■■□ 3.83
EPM2A-220ENST00000639649 GRIN2BQ13224 1484 aa38.94■■■■□ 3.82
EPM2A-220ENST00000639649 FBLN2P98095 1184 aa38.92■■■■□ 3.82
EPM2A-220ENST00000639649 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.91■■■■□ 3.82
EPM2A-220ENST00000639649 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.91■■■■□ 3.82
EPM2A-220ENST00000639649 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
EPM2A-220ENST00000639649 CHD1O14646 1710 aa38.84■■■■□ 3.81
EPM2A-220ENST00000639649 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.81■■■■□ 3.8
EPM2A-220ENST00000639649 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
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EPM2A-220ENST00000639649 SYNJ2O15056 1496 aa38.72■■■■□ 3.79
EPM2A-220ENST00000639649 TRIM41Q8WV44 630 aa38.62■■■■□ 3.77
EPM2A-220ENST00000639649 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.56■■■■□ 3.76
EPM2A-220ENST00000639649 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.56■■■■□ 3.76
EPM2A-220ENST00000639649 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.56■■■■□ 3.76
EPM2A-220ENST00000639649 ARHGEF11O15085 1522 aa38.55■■■■□ 3.76
EPM2A-220ENST00000639649 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.52■■■■□ 3.76
EPM2A-220ENST00000639649 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.47■■■■□ 3.75
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EPM2A-220ENST00000639649 ARAP1Q96P48 1450 aa38.22■■■■□ 3.71
EPM2A-220ENST00000639649 CEP170Q5SW79 1584 aa38.21■■■■□ 3.71
EPM2A-220ENST00000639649 CUL7Q14999 1698 aa38.07■■■■□ 3.69
EPM2A-220ENST00000639649 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.01■■■■□ 3.68
EPM2A-220ENST00000639649 SHROOM2Q13796 1616 aa37.97■■■■□ 3.67
EPM2A-220ENST00000639649 JPH4Q96JJ6 628 aa37.93■■■■□ 3.66
EPM2A-220ENST00000639649 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.9■■■■□ 3.66
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