RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638876.1

SLC35A3-211, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC35A3, Length 1,005 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-211ENST00000638876 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.32■■■■■ 6.13
SLC35A3-211ENST00000638876 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.53■■■■■ 5.2
SLC35A3-211ENST00000638876 ABCC9O60706 1549 aa46.95■■■■■ 5.11
SLC35A3-211ENST00000638876 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.99■■■■■ 4.79
SLC35A3-211ENST00000638876 NACADO15069 1562 aa44.84■■■■■ 4.77
SLC35A3-211ENST00000638876 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.8■■■■■ 4.76
SLC35A3-211ENST00000638876 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.45■■■■■ 4.71
SLC35A3-211ENST00000638876 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.33■■■■■ 4.69
SLC35A3-211ENST00000638876 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.09■■■■■ 4.65
SLC35A3-211ENST00000638876 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.84■■■■■ 4.61
SLC35A3-211ENST00000638876 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.83■■■■■ 4.61
SLC35A3-211ENST00000638876 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.58■■■■■ 4.57
SLC35A3-211ENST00000638876 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.45■■■■■ 4.55
SLC35A3-211ENST00000638876 SCRIBQ14160 1630 aa43.35■■■■■ 4.53
SLC35A3-211ENST00000638876 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.16■■■■■ 4.5
SLC35A3-211ENST00000638876 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
SLC35A3-211ENST00000638876 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.42■■■■■ 4.38
SLC35A3-211ENST00000638876 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.24■■■■■ 4.35
SLC35A3-211ENST00000638876 SMARCA4P51532 1647 aa41.43■■■■■ 4.22
SLC35A3-211ENST00000638876 NCAPD3P42695 1498 aa41.4■■■■■ 4.22
SLC35A3-211ENST00000638876 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
SLC35A3-211ENST00000638876 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.35■■■■■ 4.21
SLC35A3-211ENST00000638876 SMARCA2P51531 1590 aa41.29■■■■■ 4.2
SLC35A3-211ENST00000638876 HMGXB3Q12766 1538 aa41.13■■■■■ 4.17
SLC35A3-211ENST00000638876 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.07■■■■■ 4.16
SLC35A3-211ENST00000638876 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.03■■■■■ 4.16
SLC35A3-211ENST00000638876 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
SLC35A3-211ENST00000638876 WIZO95785 1651 aa40.58■■■■■ 4.09
SLC35A3-211ENST00000638876 ERCC6Q03468 1493 aa40.53■■■■■ 4.08
SLC35A3-211ENST00000638876 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
SLC35A3-211ENST00000638876 NESP48681 1621 aa40.49■■■■■ 4.07
SLC35A3-211ENST00000638876 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.34■■■■■ 4.05
SLC35A3-211ENST00000638876 CUX2O14529 1486 aa40.24■■■■■ 4.03
SLC35A3-211ENST00000638876 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.19■■■■■ 4.02
SLC35A3-211ENST00000638876 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
SLC35A3-211ENST00000638876 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.15■■■■■ 4.02
SLC35A3-211ENST00000638876 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.94■■■■□ 3.98
SLC35A3-211ENST00000638876 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
SLC35A3-211ENST00000638876 CFTRP13569 1480 aa39.84■■■■□ 3.97
SLC35A3-211ENST00000638876 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.72■■■■□ 3.95
SLC35A3-211ENST00000638876 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.71■■■■□ 3.95
SLC35A3-211ENST00000638876 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.7■■■■□ 3.95
SLC35A3-211ENST00000638876 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.69■■■■□ 3.94
SLC35A3-211ENST00000638876 WDR62O43379 1518 aa39.58■■■■□ 3.93
SLC35A3-211ENST00000638876 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.49■■■■□ 3.91
SLC35A3-211ENST00000638876 PRDM2Q13029 1718 aa39.4■■■■□ 3.9
SLC35A3-211ENST00000638876 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
SLC35A3-211ENST00000638876 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
SLC35A3-211ENST00000638876 ABCC8Q09428 1581 aa39.03■■■■□ 3.84
SLC35A3-211ENST00000638876 TOPBP1Q92547 1522 aa39.01■■■■□ 3.84
SLC35A3-211ENST00000638876 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.92■■■■□ 3.82
SLC35A3-211ENST00000638876 IFT140Q96RY7 1462 aa38.89■■■■□ 3.82
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
SLC35A3-211ENST00000638876 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
SLC35A3-211ENST00000638876 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.77
SLC35A3-211ENST00000638876 CUX1P39880 1505 aa38.55■■■■□ 3.76
SLC35A3-211ENST00000638876 OSCARQ8IYS5 282 aa38.55■■■■□ 3.76
SLC35A3-211ENST00000638876 SOGA1O94964 1423 aa38.53■■■■□ 3.76
SLC35A3-211ENST00000638876 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
SLC35A3-211ENST00000638876 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.51■■■■□ 3.76
SLC35A3-211ENST00000638876 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.5■■■■□ 3.75
SLC35A3-211ENST00000638876 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.47■■■■□ 3.75
SLC35A3-211ENST00000638876 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
SLC35A3-211ENST00000638876 WDR97A6NE52 1622 aa38.28■■■■□ 3.72
SLC35A3-211ENST00000638876 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.21■■■■□ 3.71
SLC35A3-211ENST00000638876 FBLN2P98095 1184 aa38.15■■■■□ 3.7
SLC35A3-211ENST00000638876 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.12■■■■□ 3.69
SLC35A3-211ENST00000638876 GRIN2BQ13224 1484 aa38.11■■■■□ 3.69
SLC35A3-211ENST00000638876 TOP2BQ02880 1626 aa38.11■■■■□ 3.69
SLC35A3-211ENST00000638876 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.1■■■■□ 3.69
SLC35A3-211ENST00000638876 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.09■■■■□ 3.69
SLC35A3-211ENST00000638876 CHD1O14646 1710 aa38.07■■■■□ 3.69
SLC35A3-211ENST00000638876 SYNJ1O43426 1573 aa38.06■■■■□ 3.68
SLC35A3-211ENST00000638876 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.06■■■■□ 3.68
SLC35A3-211ENST00000638876 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
SLC35A3-211ENST00000638876 TRIM41Q8WV44 630 aa38.04■■■■□ 3.68
SLC35A3-211ENST00000638876 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
SLC35A3-211ENST00000638876 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.96■■■■□ 3.67
SLC35A3-211ENST00000638876 PBRM1Q86U86 1689 aa37.92■■■■□ 3.66
SLC35A3-211ENST00000638876 SYNJ2O15056 1496 aa37.9■■■■□ 3.66
SLC35A3-211ENST00000638876 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.87■■■■□ 3.65
SLC35A3-211ENST00000638876 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.87■■■■□ 3.65
SLC35A3-211ENST00000638876 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.87■■■■□ 3.65
SLC35A3-211ENST00000638876 ARHGEF11O15085 1522 aa37.86■■■■□ 3.65
SLC35A3-211ENST00000638876 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.7■■■■□ 3.63
SLC35A3-211ENST00000638876 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.66■■■■□ 3.62
SLC35A3-211ENST00000638876 ADAMTS12P58397 1594 aa37.64■■■■□ 3.62
SLC35A3-211ENST00000638876 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.61■■■■□ 3.61
SLC35A3-211ENST00000638876 GRIN2AQ12879 1464 aa37.6■■■■□ 3.61
SLC35A3-211ENST00000638876 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.59■■■■□ 3.61
SLC35A3-211ENST00000638876 ARAP1Q96P48 1450 aa37.52■■■■□ 3.6
SLC35A3-211ENST00000638876 NUP160Q12769 1436 aa37.46■■■■□ 3.59
SLC35A3-211ENST00000638876 KIF27Q86VH2 1401 aa37.46■■■■□ 3.59
SLC35A3-211ENST00000638876 CEP170Q5SW79 1584 aa37.4■■■■□ 3.58
SLC35A3-211ENST00000638876 IGF1RP08069 1367 aa37.34■■■■□ 3.57
SLC35A3-211ENST00000638876 CUL7Q14999 1698 aa37.21■■■■□ 3.55
SLC35A3-211ENST00000638876 SHROOM2Q13796 1616 aa37.17■■■■□ 3.54
SLC35A3-211ENST00000638876 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.13■■■■□ 3.53
SLC35A3-211ENST00000638876 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.13■■■■□ 3.53
SLC35A3-211ENST00000638876 JPH4Q96JJ6 628 aa37.12■■■■□ 3.53
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