RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637110.1

CLN3-257, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 565 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-257ENST00000637110 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.45■■■□□ 2.15
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CLN3-257ENST00000637110 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.92■■□□□ 1.58
CLN3-257ENST00000637110 NACADO15069 1562 aa24.59■■□□□ 1.53
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CLN3-257ENST00000637110 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.05■■□□□ 1.44
CLN3-257ENST00000637110 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.87■■□□□ 1.41
CLN3-257ENST00000637110 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.87■■□□□ 1.41
CLN3-257ENST00000637110 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.83■■□□□ 1.41
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CLN3-257ENST00000637110 NESP48681 1621 aa22.46■■□□□ 1.19
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CLN3-257ENST00000637110 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
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CLN3-257ENST00000637110 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.02■■□□□ 1.12
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CLN3-257ENST00000637110 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.95■■□□□ 1.1
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CLN3-257ENST00000637110 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.88■■□□□ 1.09
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CLN3-257ENST00000637110 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.71■■□□□ 1.07
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CLN3-257ENST00000637110 WIZO95785 1651 aa21.6■■□□□ 1.05
CLN3-257ENST00000637110 CFTRP13569 1480 aa21.58■■□□□ 1.04
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CLN3-257ENST00000637110 ARHGEF11O15085 1522 aa21.53■■□□□ 1.04
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CLN3-257ENST00000637110 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.08■□□□□ 0.97
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CLN3-257ENST00000637110 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.33■□□□□ 0.85
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CLN3-257ENST00000637110 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
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CLN3-257ENST00000637110 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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