RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635899.1

CREBBP-215, Transcript of CREB binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene CREBBP, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBBP-215ENST00000635899 NISCHQ9Y2I1 1504 aa11.48□□□□□ -0.57
CREBBP-215ENST00000635899 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa10.51□□□□□ -0.73
CREBBP-215ENST00000635899 ABCC9O60706 1549 aa10.34□□□□□ -0.75
CREBBP-215ENST00000635899 UNC13AQ9UPW8 1703 aa9.93□□□□□ -0.82
CREBBP-215ENST00000635899 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa9.92□□□□□ -0.82
CREBBP-215ENST00000635899 NACADO15069 1562 aa9.8□□□□□ -0.84
CREBBP-215ENST00000635899 BICRAQ9NZM4 1560 aa9.62□□□□□ -0.87
CREBBP-215ENST00000635899 MYO15BQ96JP2 1530 aa9.61□□□□□ -0.87
CREBBP-215ENST00000635899 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CREBBP-215ENST00000635899 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.55□□□□□ -0.88
CREBBP-215ENST00000635899 DCAF8L2P0C7V8 631 aa9.54□□□□□ -0.88
CREBBP-215ENST00000635899 SCRIBQ14160 1630 aa9.53□□□□□ -0.88
CREBBP-215ENST00000635899 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
CREBBP-215ENST00000635899 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa9.49□□□□□ -0.89
CREBBP-215ENST00000635899 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa9.46□□□□□ -0.9
CREBBP-215ENST00000635899 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa9.43□□□□□ -0.9
CREBBP-215ENST00000635899 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CREBBP-215ENST00000635899 CECR2Q9BXF3 1484 aa9.3□□□□□ -0.92
CREBBP-215ENST00000635899 SMARCA4P51532 1647 aa9.07□□□□□ -0.96
CREBBP-215ENST00000635899 HMGXB3Q12766 1538 aa9.01□□□□□ -0.97
CREBBP-215ENST00000635899 SMARCA2P51531 1590 aa8.99□□□□□ -0.97
CREBBP-215ENST00000635899 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.98□□□□□ -0.97
CREBBP-215ENST00000635899 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
CREBBP-215ENST00000635899 ERCC6Q03468 1493 aa8.95□□□□□ -0.98
CREBBP-215ENST00000635899 CUX2O14529 1486 aa8.94□□□□□ -0.98
CREBBP-215ENST00000635899 NCAPD3P42695 1498 aa8.94□□□□□ -0.98
CREBBP-215ENST00000635899 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.94□□□□□ -0.98
CREBBP-215ENST00000635899 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CREBBP-215ENST00000635899 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.94□□□□□ -0.98
CREBBP-215ENST00000635899 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CREBBP-215ENST00000635899 NESP48681 1621 aa8.89□□□□□ -0.99
CREBBP-215ENST00000635899 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.89□□□□□ -0.99
CREBBP-215ENST00000635899 PRDM2Q13029 1718 aa8.88□□□□□ -0.99
CREBBP-215ENST00000635899 WIZO95785 1651 aa8.86□□□□□ -0.99
CREBBP-215ENST00000635899 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.86□□□□□ -0.99
CREBBP-215ENST00000635899 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.79□□□□□ -1
CREBBP-215ENST00000635899 WDR62O43379 1518 aa8.73□□□□□ -1.01
CREBBP-215ENST00000635899 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.7□□□□□ -1.02
CREBBP-215ENST00000635899 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.7□□□□□ -1.02
CREBBP-215ENST00000635899 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CREBBP-215ENST00000635899 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.68□□□□□ -1.02
CREBBP-215ENST00000635899 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.64□□□□□ -1.03
CREBBP-215ENST00000635899 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.64□□□□□ -1.03
CREBBP-215ENST00000635899 CFTRP13569 1480 aa8.59□□□□□ -1.03
CREBBP-215ENST00000635899 CHD1O14646 1710 aa8.59□□□□□ -1.03
CREBBP-215ENST00000635899 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CREBBP-215ENST00000635899 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CREBBP-215ENST00000635899 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CREBBP-215ENST00000635899 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.52□□□□□ -1.05
CREBBP-215ENST00000635899 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.52□□□□□ -1.05
CREBBP-215ENST00000635899 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.52□□□□□ -1.05
CREBBP-215ENST00000635899 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.51□□□□□ -1.05
CREBBP-215ENST00000635899 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.49□□□□□ -1.05
CREBBP-215ENST00000635899 TOPBP1Q92547 1522 aa8.49□□□□□ -1.05
CREBBP-215ENST00000635899 WDR97A6NE52 1622 aa8.48□□□□□ -1.05
CREBBP-215ENST00000635899 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CREBBP-215ENST00000635899 PBRM1Q86U86 1689 aa8.48□□□□□ -1.05
CREBBP-215ENST00000635899 IFT140Q96RY7 1462 aa8.46□□□□□ -1.05
CREBBP-215ENST00000635899 TRIM41Q8WV44 630 aa8.46□□□□□ -1.06
CREBBP-215ENST00000635899 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CREBBP-215ENST00000635899 ABCC8Q09428 1581 aa8.43□□□□□ -1.06
CREBBP-215ENST00000635899 ARHGEF11O15085 1522 aa8.41□□□□□ -1.06
CREBBP-215ENST00000635899 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CREBBP-215ENST00000635899 OSCARQ8IYS5 282 aa8.36□□□□□ -1.07
CREBBP-215ENST00000635899 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.35□□□□□ -1.07
CREBBP-215ENST00000635899 CUX1P39880 1505 aa8.34□□□□□ -1.07
CREBBP-215ENST00000635899 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.34□□□□□ -1.07
CREBBP-215ENST00000635899 SYNJ1O43426 1573 aa8.34□□□□□ -1.07
CREBBP-215ENST00000635899 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.34□□□□□ -1.08
CREBBP-215ENST00000635899 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CREBBP-215ENST00000635899 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.32□□□□□ -1.08
CREBBP-215ENST00000635899 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.32□□□□□ -1.08
CREBBP-215ENST00000635899 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.32□□□□□ -1.08
CREBBP-215ENST00000635899 ARAP1Q96P48 1450 aa8.32□□□□□ -1.08
CREBBP-215ENST00000635899 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CREBBP-215ENST00000635899 ADAMTS12P58397 1594 aa8.28□□□□□ -1.08
CREBBP-215ENST00000635899 SOGA1O94964 1423 aa8.27□□□□□ -1.09
CREBBP-215ENST00000635899 GRIN2BQ13224 1484 aa8.26□□□□□ -1.09
CREBBP-215ENST00000635899 TOP2BQ02880 1626 aa8.25□□□□□ -1.09
CREBBP-215ENST00000635899 SYNJ2O15056 1496 aa8.25□□□□□ -1.09
CREBBP-215ENST00000635899 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CREBBP-215ENST00000635899 FBLN2P98095 1184 aa8.23□□□□□ -1.09
CREBBP-215ENST00000635899 KIF13AQ9H1H9 1805 aa8.23□□□□□ -1.09
CREBBP-215ENST00000635899 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.23□□□□□ -1.09
CREBBP-215ENST00000635899 CEP170Q5SW79 1584 aa8.22□□□□□ -1.09
CREBBP-215ENST00000635899 SHROOM2Q13796 1616 aa8.22□□□□□ -1.09
CREBBP-215ENST00000635899 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.22□□□□□ -1.09
CREBBP-215ENST00000635899 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.19□□□□□ -1.1
CREBBP-215ENST00000635899 GRIN2AQ12879 1464 aa8.19□□□□□ -1.1
CREBBP-215ENST00000635899 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.18□□□□□ -1.1
CREBBP-215ENST00000635899 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.18□□□□□ -1.1
CREBBP-215ENST00000635899 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.15□□□□□ -1.1
CREBBP-215ENST00000635899 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CREBBP-215ENST00000635899 CUL7Q14999 1698 aa8.14□□□□□ -1.11
CREBBP-215ENST00000635899 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.14□□□□□ -1.11
CREBBP-215ENST00000635899 TSPOAP1O95153 1857 aa8.13□□□□□ -1.11
CREBBP-215ENST00000635899 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CREBBP-215ENST00000635899 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CREBBP-215ENST00000635899 NUP160Q12769 1436 aa8.12□□□□□ -1.11
CREBBP-215ENST00000635899 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms