RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635375.1

QARS-241, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene QARS, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QARS-241ENST00000635375 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.07■■■□□ 2.24
QARS-241ENST00000635375 ABCC9O60706 1549 aa25.91■■□□□ 1.74
QARS-241ENST00000635375 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.75■■□□□ 1.71
QARS-241ENST00000635375 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.59■■□□□ 1.53
QARS-241ENST00000635375 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.43■■□□□ 1.5
QARS-241ENST00000635375 NACADO15069 1562 aa24.38■■□□□ 1.49
QARS-241ENST00000635375 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.37■■□□□ 1.49
QARS-241ENST00000635375 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
QARS-241ENST00000635375 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.469e-8■■■■□ 20.2
QARS-241ENST00000635375 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.05■■□□□ 1.44
QARS-241ENST00000635375 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.99■■□□□ 1.43
QARS-241ENST00000635375 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.93■■□□□ 1.42
QARS-241ENST00000635375 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.8■■□□□ 1.4
QARS-241ENST00000635375 SCRIBQ14160 1630 aa23.6■■□□□ 1.37
QARS-241ENST00000635375 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.51■■□□□ 1.35
QARS-241ENST00000635375 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.36■■□□□ 1.33
QARS-241ENST00000635375 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.36■■□□□ 1.33
QARS-241ENST00000635375 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
QARS-241ENST00000635375 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.57■■□□□ 1.2
QARS-241ENST00000635375 SMARCA4P51532 1647 aa22.55■■□□□ 1.2
QARS-241ENST00000635375 NCAPD3P42695 1498 aa22.51■■□□□ 1.19
QARS-241ENST00000635375 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.47■■□□□ 1.19
QARS-241ENST00000635375 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
QARS-241ENST00000635375 ERCC6Q03468 1493 aa22.44■■□□□ 1.18
QARS-241ENST00000635375 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.44■■□□□ 1.18
QARS-241ENST00000635375 SMARCA2P51531 1590 aa22.38■■□□□ 1.17
QARS-241ENST00000635375 CUX2O14529 1486 aa22.36■■□□□ 1.17
QARS-241ENST00000635375 HMGXB3Q12766 1538 aa22.31■■□□□ 1.16
QARS-241ENST00000635375 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.3■■□□□ 1.16
QARS-241ENST00000635375 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
QARS-241ENST00000635375 WIZO95785 1651 aa22.23■■□□□ 1.15
QARS-241ENST00000635375 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
QARS-241ENST00000635375 NESP48681 1621 aa22.19■■□□□ 1.14
QARS-241ENST00000635375 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.02■■□□□ 1.12
QARS-241ENST00000635375 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.97■■□□□ 1.11
QARS-241ENST00000635375 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
QARS-241ENST00000635375 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
QARS-241ENST00000635375 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.87■■□□□ 1.09
QARS-241ENST00000635375 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.86■■□□□ 1.09
QARS-241ENST00000635375 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.74■■□□□ 1.07
QARS-241ENST00000635375 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.71■■□□□ 1.07
QARS-241ENST00000635375 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
QARS-241ENST00000635375 WDR62O43379 1518 aa21.65■■□□□ 1.06
QARS-241ENST00000635375 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.64■■□□□ 1.06
QARS-241ENST00000635375 CFTRP13569 1480 aa21.62■■□□□ 1.05
QARS-241ENST00000635375 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.61■■□□□ 1.05
QARS-241ENST00000635375 TRIM41Q8WV44 630 aa21.56■■□□□ 1.04
QARS-241ENST00000635375 PRDM2Q13029 1718 aa21.41■■□□□ 1.02
QARS-241ENST00000635375 OSCARQ8IYS5 282 aa21.41■■□□□ 1.02
QARS-241ENST00000635375 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
QARS-241ENST00000635375 IFT140Q96RY7 1462 aa21.21■□□□□ 0.99
QARS-241ENST00000635375 TOPBP1Q92547 1522 aa21.18■□□□□ 0.98
QARS-241ENST00000635375 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
QARS-241ENST00000635375 ABCC8Q09428 1581 aa21.15■□□□□ 0.98
QARS-241ENST00000635375 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.11■□□□□ 0.97
QARS-241ENST00000635375 CUX1P39880 1505 aa21.06■□□□□ 0.96
QARS-241ENST00000635375 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.03■□□□□ 0.96
QARS-241ENST00000635375 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.03■□□□□ 0.96
QARS-241ENST00000635375 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.03■□□□□ 0.96
QARS-241ENST00000635375 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
QARS-241ENST00000635375 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
QARS-241ENST00000635375 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.951e-6■■■■□ 21.5
QARS-241ENST00000635375 FBLN2P98095 1184 aa20.99■□□□□ 0.95
QARS-241ENST00000635375 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.97■□□□□ 0.95
QARS-241ENST00000635375 ARHGEF11O15085 1522 aa20.97■□□□□ 0.95
QARS-241ENST00000635375 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
QARS-241ENST00000635375 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.95■□□□□ 0.94
QARS-241ENST00000635375 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.93■□□□□ 0.94
QARS-241ENST00000635375 SOGA1O94964 1423 aa20.9■□□□□ 0.94
QARS-241ENST00000635375 SYNJ1O43426 1573 aa20.89■□□□□ 0.93
QARS-241ENST00000635375 CHD1O14646 1710 aa20.87■□□□□ 0.93
QARS-241ENST00000635375 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
QARS-241ENST00000635375 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
QARS-241ENST00000635375 TOP2BQ02880 1626 aa20.82■□□□□ 0.92
QARS-241ENST00000635375 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.82■□□□□ 0.92
QARS-241ENST00000635375 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
QARS-241ENST00000635375 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
QARS-241ENST00000635375 WDR97A6NE52 1622 aa20.78■□□□□ 0.92
QARS-241ENST00000635375 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.76■□□□□ 0.91
QARS-241ENST00000635375 ARAP1Q96P48 1450 aa20.75■□□□□ 0.91
QARS-241ENST00000635375 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.73■□□□□ 0.91
QARS-241ENST00000635375 GRIN2BQ13224 1484 aa20.7■□□□□ 0.9
QARS-241ENST00000635375 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
QARS-241ENST00000635375 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.66■□□□□ 0.9
QARS-241ENST00000635375 SYNJ2O15056 1496 aa20.64■□□□□ 0.89
QARS-241ENST00000635375 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.64■□□□□ 0.89
QARS-241ENST00000635375 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.63■□□□□ 0.89
QARS-241ENST00000635375 PBRM1Q86U86 1689 aa20.6■□□□□ 0.89
QARS-241ENST00000635375 ADAMTS12P58397 1594 aa20.45■□□□□ 0.86
QARS-241ENST00000635375 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.43■□□□□ 0.86
QARS-241ENST00000635375 GRIN2AQ12879 1464 aa20.42■□□□□ 0.86
QARS-241ENST00000635375 IGF1RP08069 1367 aa20.41■□□□□ 0.86
QARS-241ENST00000635375 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.4■□□□□ 0.86
QARS-241ENST00000635375 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.38■□□□□ 0.85
QARS-241ENST00000635375 KIF27Q86VH2 1401 aa20.38■□□□□ 0.85
QARS-241ENST00000635375 NUP160Q12769 1436 aa20.33■□□□□ 0.84
QARS-241ENST00000635375 CEP170Q5SW79 1584 aa20.33■□□□□ 0.84
QARS-241ENST00000635375 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.29■□□□□ 0.84
QARS-241ENST00000635375 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
QARS-241ENST00000635375 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms