RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629113.1

LEMD1-210, Transcript of LEM domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene LEMD1, Length 314 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1-210ENST00000629113 NISCHQ9Y2I1 1504 aa70.08■■■■■ 8.81
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LEMD1-210ENST00000629113 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa59.61■■■■■ 7.13
LEMD1-210ENST00000629113 NACADO15069 1562 aa59.24■■■■■ 7.07
LEMD1-210ENST00000629113 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.22■■■■■ 7.07
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LEMD1-210ENST00000629113 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.47■■■■■ 6.95
LEMD1-210ENST00000629113 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.43■■■■■ 6.94
LEMD1-210ENST00000629113 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58.39■■■■■ 6.94
LEMD1-210ENST00000629113 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.11■■■■■ 6.89
LEMD1-210ENST00000629113 BICRAQ9NZM4 1560 aa57.98■■■■■ 6.87
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LEMD1-210ENST00000629113 SCRIBQ14160 1630 aa57.3■■■■■ 6.76
LEMD1-210ENST00000629113 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.97■■■■■ 6.71
LEMD1-210ENST00000629113 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.59■■■■■ 6.65
LEMD1-210ENST00000629113 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.48■■■■■ 6.63
LEMD1-210ENST00000629113 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.38■■■■■ 6.62
LEMD1-210ENST00000629113 NCAPD3P42695 1498 aa54.73■■■■■ 6.35
LEMD1-210ENST00000629113 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.64■■■■■ 6.34
LEMD1-210ENST00000629113 SMARCA4P51532 1647 aa54.62■■■■■ 6.34
LEMD1-210ENST00000629113 SMARCA2P51531 1590 aa54.42■■■■■ 6.3
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LEMD1-210ENST00000629113 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.08■■■■■ 6.25
LEMD1-210ENST00000629113 ERCC6Q03468 1493 aa54.03■■■■■ 6.24
LEMD1-210ENST00000629113 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.02■■■■■ 6.24
LEMD1-210ENST00000629113 NESP48681 1621 aa53.94■■■■■ 6.23
LEMD1-210ENST00000629113 CUX2O14529 1486 aa53.78■■■■■ 6.2
LEMD1-210ENST00000629113 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa53.63■■■■■ 6.18
LEMD1-210ENST00000629113 WIZO95785 1651 aa53.45■■■■■ 6.15
LEMD1-210ENST00000629113 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.43■■■■■ 6.14
LEMD1-210ENST00000629113 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.24■■■■■ 6.11
LEMD1-210ENST00000629113 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.19■■■■■ 6.11
LEMD1-210ENST00000629113 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.12■■■■■ 6.09
LEMD1-210ENST00000629113 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.1■■■■■ 6.09
LEMD1-210ENST00000629113 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53■■■■■ 6.08
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LEMD1-210ENST00000629113 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.69■■■■■ 6.02
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LEMD1-210ENST00000629113 CFTRP13569 1480 aa52.53■■■■■ 6
LEMD1-210ENST00000629113 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.51■■■■■ 6
LEMD1-210ENST00000629113 CEP164Q9UPV0 1460 aa52.51■■■■■ 6
LEMD1-210ENST00000629113 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.17■■■■■ 5.94
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LEMD1-210ENST00000629113 TOPBP1Q92547 1522 aa51.55■■■■■ 5.84
LEMD1-210ENST00000629113 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.47■■■■■ 5.83
LEMD1-210ENST00000629113 OSCARQ8IYS5 282 aa51.46■■■■■ 5.83
LEMD1-210ENST00000629113 TRIM41Q8WV44 630 aa51.45■■■■■ 5.83
LEMD1-210ENST00000629113 IFT140Q96RY7 1462 aa51.45■■■■■ 5.83
LEMD1-210ENST00000629113 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.34■■■■■ 5.81
LEMD1-210ENST00000629113 ABCC8Q09428 1581 aa51.33■■■■■ 5.81
LEMD1-210ENST00000629113 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.11■■■■■ 5.77
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LEMD1-210ENST00000629113 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50.78■■■■■ 5.72
LEMD1-210ENST00000629113 CUX1P39880 1505 aa50.77■■■■■ 5.72
LEMD1-210ENST00000629113 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.77■■■■■ 5.72
LEMD1-210ENST00000629113 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.75■■■■■ 5.71
LEMD1-210ENST00000629113 CHD1O14646 1710 aa50.74■■■■■ 5.71
LEMD1-210ENST00000629113 FBLN2P98095 1184 aa50.66■■■■■ 5.7
LEMD1-210ENST00000629113 ARHGEF11O15085 1522 aa50.62■■■■■ 5.69
LEMD1-210ENST00000629113 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.46■■■■■ 5.67
LEMD1-210ENST00000629113 WDR97A6NE52 1622 aa50.41■■■■■ 5.66
LEMD1-210ENST00000629113 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.32■■■■■ 5.65
LEMD1-210ENST00000629113 GRIN2BQ13224 1484 aa50.31■■■■■ 5.64
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LEMD1-210ENST00000629113 ARAP1Q96P48 1450 aa50.17■■■■■ 5.62
LEMD1-210ENST00000629113 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.16■■■■■ 5.62
LEMD1-210ENST00000629113 PBRM1Q86U86 1689 aa50.16■■■■■ 5.62
LEMD1-210ENST00000629113 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.11■■■■■ 5.61
LEMD1-210ENST00000629113 SYNJ2O15056 1496 aa50.11■■■■■ 5.61
LEMD1-210ENST00000629113 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.07■■■■■ 5.61
LEMD1-210ENST00000629113 SYNJ1O43426 1573 aa50.06■■■■■ 5.6
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LEMD1-210ENST00000629113 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.96■■■■■ 5.59
LEMD1-210ENST00000629113 TOP2BQ02880 1626 aa49.95■■■■■ 5.59
LEMD1-210ENST00000629113 ADAMTS12P58397 1594 aa49.68■■■■■ 5.54
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LEMD1-210ENST00000629113 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.54■■■■■ 5.52
LEMD1-210ENST00000629113 CEP170Q5SW79 1584 aa49.53■■■■■ 5.52
LEMD1-210ENST00000629113 NUP160Q12769 1436 aa49.5■■■■■ 5.51
LEMD1-210ENST00000629113 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.5■■■■■ 5.51
LEMD1-210ENST00000629113 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.47■■■■■ 5.51
LEMD1-210ENST00000629113 SHROOM2Q13796 1616 aa49.24■■■■■ 5.47
LEMD1-210ENST00000629113 JPH4Q96JJ6 628 aa49.06■■■■■ 5.44
LEMD1-210ENST00000629113 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.05■■■■■ 5.44
LEMD1-210ENST00000629113 IGF1RP08069 1367 aa49.02■■■■■ 5.44
LEMD1-210ENST00000629113 KIF27Q86VH2 1401 aa48.98■■■■■ 5.43
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